MYOD1

MYOD1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1MDY

Ідентифікатори
Символи MYOD1, MYF3, MYOD, PUM, bHLHc1, myogenic differentiation 1, MYODRIF
Зовнішні ІД OMIM: 159970 MGI: 97275 HomoloGene: 7857 GeneCards: MYOD1
Онтологія гена
Молекулярна функція

DNA binding
sequence-specific DNA binding
RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
protein dimerization activity
GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
transcription factor binding
chromatin binding
GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
E-box binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
protein heterodimerization activity
enzyme binding
transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding
chromatin DNA binding
ubiquitin protein ligase binding
GO:0001105 transcription coactivator activity
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
promoter-specific chromatin binding

Клітинна компонента

transcription regulator complex
нуклеоплазма
міофібрила
клітинне ядро
цитоплазма
гіалоплазма
ядерні тільця

Біологічний процес

диференціація клітин
myotube differentiation
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
cellular response to starvation
muscle cell fate commitment
cellular response to estradiol stimulus
skeletal muscle fiber adaptation
muscle organ development
regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome
myotube cell development
positive regulation of skeletal muscle fiber development
negative regulation of myoblast proliferation
transcription, DNA-templated
multicellular organism development
GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated
protein phosphorylation
regulation of RNA splicing
positive regulation of myoblast fusion
myoblast fate determination
cellular response to glucocorticoid stimulus
positive regulation of myoblast differentiation
skeletal muscle fiber development
histone H3 acetylation
myotube differentiation involved in skeletal muscle regeneration
histone H4 acetylation
skeletal muscle cell differentiation
positive regulation of skeletal muscle tissue regeneration
регуляція експресії генів
striated muscle cell differentiation
cellular response to oxygen levels
myoblast fusion
myoblast differentiation
skeletal muscle tissue development
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
transcription by RNA polymerase II
positive regulation of muscle cell differentiation
cellular response to tumor necrosis factor
positive regulation of snRNA transcription by RNA polymerase II

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
4654
17927
Ensembl
ENSG00000129152
ENSMUSG00000009471
UniProt
P15172
P10085
RefSeq (мРНК)
NM_002478
NM_010866
RefSeq (білок)
NP_002469
NP_034996
Локус (UCSC) Хр. 11: 17.72 – 17.72 Mb Хр. 7: 46.03 – 46.03 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

MYOD1 (англ. Myogenic differentiation 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 320 амінокислот, а молекулярна маса — 34 501[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MELLSPPLRDVDLTAPDGSLCSFATTDDFYDDPCFDSPDLRFFEDLDPRL
MHVGALLKPEEHSHFPAAVHPAPGAREDEHVRAPSGHHQAGRCLLWACKA
CKRKTTNADRRKAATMRERRRLSKVNEAFETLKRCTSSNPNQRLPKVEIL
RNAIRYIEGLQALLRDQDAAPPGAAAAFYAPGPLPPGRGGEHYSGDSDAS
SPRSNCSDGMMDYSGPPSGARRRNCYEGAYYNEAPSEPRPGKSAAVSSLD
CLSSIVERISTESPAAPALLLADVPSESPPRRQEAAAPSEGESSGDPTQS
PDAAPQCPAGANPNPIYQVL

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, міогенез, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі. Втрата контролю над цим перемикачем може стати причиною утворення рабдоміосаркоми[5][6].

Література

  • Pearson-White S.H. (1991). Human MyoD: cDNA and deduced amino acid sequence. Nucleic Acids Res. 19: 1148—1148. PMID 1850513 DOI:10.1093/nar/19.5.1148
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Breitschopf K., Bengal E., Ziv T., Admon A., Ciechanover A. (1998). A novel site for ubiquitination: the N-terminal residue, and not internal lysines of MyoD, is essential for conjugation and degradation of the protein. EMBO J. 17: 5964—5973. PMID 9774340 DOI:10.1093/emboj/17.20.5964
  • McKinsey T.A., Zhang C.L., Olson E.N. (2001). Control of muscle development by dueling HATs and HDACs. Curr. Opin. Genet. Dev. 11: 497—504. PMID 11532390 DOI:10.1016/S0959-437X(00)00224-0
  • Mal A.K. (2006). Histone methyltransferase Suv39h1 represses MyoD-stimulated myogenic differentiation. EMBO J. 25: 3323—3334. PMID 16858404 DOI:10.1038/sj.emboj.7601229
  • Chen B., Dias P., Jenkins J.J. III, Savell V.H., Parham D.M. (1998). Methylation alterations of the MyoD1 upstream region are predictive of subclassification of human rhabdomyosarcomas. Am. J. Pathol. 152: 1071—1079. PMID 9546368

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7611 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
  4. UniProt, P15172 (англ.) . Архів оригіналу за 6 жовтня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
  5. https://www.worldcommunitygrid.org/about_us/article.s?articleId=783
  6. https://jcp.bmj.com/content/56/6/412

Див. також

  • Хромосома 11
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші