BACH1

BACH1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

2IHC

Ідентифікатори
Символи BACH1, BACH-1, BTBD24, BTB domain and CNC homolog 1
Зовнішні ІД OMIM: 602751 MGI: 894680 HomoloGene: 916 GeneCards: BACH1
Пов'язані генетичні захворювання
рак підшлункової залози[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
DNA binding
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity
GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific
GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
heme binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific

Клітинна компонента

цитоплазма
гіалоплазма
Cul3-RING ubiquitin ligase complex
клітинне ядро

Біологічний процес

GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
regulation of transcription involved in G1/S transition of mitotic cell cycle
transcription, DNA-templated
regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia
GO:0100026 Репарація ДНК
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
regulation of transcription involved in G2/M transition of mitotic cell cycle
Убіквітин-залежний протеоліз
transcription by RNA polymerase II

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
571
12013
Ensembl
ENSG00000156273
ENSMUSG00000025612
UniProt
O14867
P97302
RefSeq (мРНК)
NM_001011545
NM_001186
NM_206866
NM_007520
RefSeq (білок)
NP_001177
NP_996749
NP_031546
Локус (UCSC) Хр. 21: 29.19 – 29.63 Mb Хр. 16: 87.5 – 87.53 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

BACH1 (англ. BTB domain and CNC homolog 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 21-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 736 амінокислот, а молекулярна маса — 81 958[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MSLSENSVFAYESSVHSTNVLLSLNDQRKKDVLCDVTIFVEGQRFRAHRS
VLAACSSYFHSRIVGQADGELNITLPEEVTVKGFEPLIQFAYTAKLILSK
ENVDEVCKCVEFLSVHNIEESCFQFLKFKFLDSTADQQECPRKKCFSSHC
QKTDLKLSLLDQRDLETDEVEEFLENKNVQTPQCKLRRYQGNAKASPPLQ
DSASQTYESMCLEKDAALALPSLCPKYRKFQKAFGTDRVRTGESSVKDIH
ASVQPNERSENECLGGVPECRDLQVMLKCDESKLAMEPEETKKDPASQCP
TEKSEVTPFPHNSSIDPHGLYSLSLLHTYDQYGDLNFAGMQNTTVLTEKP
LSGTDVQEKTFGESQDLPLKSDLGTREDSSVASSDRSSVEREVAEHLAKG
FWSDICSTDTPCQMQLSPAVAKDGSEQISQKRSECPWLGIRISESPEPGQ
RTFTTLSSVNCPFISTLSTEGCSSNLEIGNDDYVSEPQQEPCPYACVISL
GDDSETDTEGDSESCSAREQECEVKLPFNAQRIISLSRNDFQSLLKMHKL
TPEQLDCIHDIRRRSKNRIAAQRCRKRKLDCIQNLESEIEKLQSEKESLL
KERDHILSTLGETKQNLTGLCQKVCKEAALSQEQIQILAKYSAADCPLSF
LISEKDKSTPDGELALPSIFSLSDRPPAVLPPCARGNSEPGYARGQESQQ
MSTATSEQAGPAEQCRQSGGISDFCQQMTDKCTTDE

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з BACH1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:935 (англ.) . Архів оригіналу за 3 квітня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
  5. UniProt, O14867 (англ.) . Архів оригіналу за 4 жовтня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 21
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші