SP7

SP7
Ідентифікатори
Символи SP7, OI11, OI12, OSX, osterix, Sp7 transcription factor
Зовнішні ІД OMIM: 606633 MGI: 2153568 HomoloGene: 15607 GeneCards: SP7
Пов'язані генетичні захворювання
osteogenesis imperfecta type 12[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

nucleic acid binding
GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
DNA binding
DEAD/H-box RNA helicase binding
зв'язування з іоном металу
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific

Клітинна компонента

клітинне ядро
цитоплазма

Біологічний процес

osteoblast differentiation
transcription, DNA-templated
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
transcription by RNA polymerase II
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
hematopoietic stem cell differentiation
positive regulation of stem cell differentiation

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
121340
170574
Ensembl
ENSG00000170374
ENSMUSG00000060284
UniProt
Q8TDD2
Q8VI67
RefSeq (мРНК)
NM_001173467
NM_001300837
NM_152860
NM_130458
NM_001348205
RefSeq (білок)
NP_001287766.1
NP_001166938
NP_001287766
NP_690599
NP_569725
NP_001335134
Локус (UCSC) Хр. 12: 53.33 – 53.35 Mb Хр. 15: 102.27 – 102.28 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

SP7 (англ. Sp7 transcription factor 7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 428 амінокислот, а молекулярна маса — 44 718[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MASSLLEEEAHYGSSPLAMLTAACSKFGGSSPLRDSTTLGKGGTKKPYAD
LSAPKTMGDAYPAPFSSTNGLLSPAGSPPAPASGYANDYPPFPHSFPGPT
GAQDPGLLVPKGHSSSDCLPSVYTSLDMTHPYGSWYKAGIHAGISPGPGN
TPTPWWDMHPGGNWLGGGQGQGDGLQGTLSTGPAQPPLNPQLPTYPSDFA
PLNPAPYPAPHLLQPGPQHVLPQDVYKPKAVGNSGQLEGSGAAKPPRGAG
TGGSGGYAGSGAGRSTCDCPNCQELERLGAAAAGLRKKPIHSCHIPGCGK
VYGKASHLKAHLRWHTGERPFVCNWLFCGKRFTRSDELERHVRTHTREKK
FTCLLCSKRFTRSDHLSKHQRTHGEPGPGPPPSGPKELGEGRSVGEEEAN
QPPRSSTSPAPPEKAHGGSPEQSNLLEI

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • Sinha K.M., Yasuda H., Coombes M.M., Dent S.Y., de Crombrugghe B. (2010). Regulation of the osteoblast-specific transcription factor Osterix by NO66, a Jumonji family histone demethylase. EMBO J. 29: 68—79. PMID 19927124 DOI:10.1038/emboj.2009.332

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з SP7 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2015. Процитовано 11 вересня 2017.
  5. UniProt, Q8VI67 (англ.) . Архів оригіналу за 7 грудня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 12
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші