NFE2L1

NFE2L1
Ідентифікатори
Символи NFE2L1, LCR-F1, NRF1, TCF11, nuclear factor, erythroid 2 like 1, NRF-1, NFE2 like bZIP transcription factor 1
Зовнішні ІД OMIM: 163260 MGI: 99421 HomoloGene: 20685 GeneCards: NFE2L1
Онтологія гена
Молекулярна функція

GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
DNA binding
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
GO:0001104 transcription coregulator activity
GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding
GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
protein domain specific binding
GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific
cholesterol binding
protein heterodimerization activity
lipid binding
GO:0032403 protein-containing complex binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
chromatin binding
promoter-specific chromatin binding

Клітинна компонента

integral component of membrane
endoplasmic reticulum membrane
мембрана
ендоплазматичний ретикулум
клітинне ядро
цитоплазма
гіалоплазма
integral component of endoplasmic reticulum membrane
GO:0009327 protein-containing complex

Біологічний процес

GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
anatomical structure morphogenesis
transcription, DNA-templated
GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated
heme biosynthetic process
erythrocyte differentiation
inflammatory response
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
transcription by RNA polymerase II
cellular response to oxidative stress
positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to stress
cell redox homeostasis
lipid homeostasis
cellular response to cholesterol
negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to stress
regulation of odontoblast differentiation
lipid metabolism
steroid metabolic process
cholesterol metabolic process
cholesterol homeostasis
protein polyubiquitination
fructose 6-phosphate metabolic process
glutathione metabolic process
regulation of mitotic nuclear division
регуляція експресії генів
regulation of glucose metabolic process
regulation of lipid metabolic process
regulation of fatty acid metabolic process
cellular homeostasis
spinal cord motor neuron differentiation
glial cell fate commitment
response to endoplasmic reticulum stress
cysteine transport
regulation of inflammatory response
glucose 6-phosphate metabolic process
regulation of proteasomal protein catabolic process
cellular response to cold
regulation of nucleus organization
regulation of response to endoplasmic reticulum stress

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії




Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
4779
18023
Ensembl
ENSG00000082641
ENSMUSG00000038615
UniProt
Q14494
Q61985
RefSeq (мРНК)
NM_003204
NM_001330261
NM_001330262
NM_001130450
NM_001130451
NM_001130452
NM_001130453
NM_001130454
NM_008686
NM_001361682
RefSeq (білок)
NP_001317190
NP_001317191
NP_003195
NP_001123922
NP_001123923
NP_001123924
NP_001123925
NP_001123926
NP_032712
NP_001348611
Локус (UCSC) Хр. 17: 48.05 – 48.06 Mb Хр. 11: 96.71 – 96.72 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

NFE2L1 (англ. Nuclear factor, erythroid 2 like 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 772 амінокислот, а молекулярна маса — 84 704[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MLSLKKYLTEGLLQFTILLSLIGVRVDVDTYLTSQLPPLREIILGPSSAY
TQTQFHNLRNTLDGYGIHPKSIDLDNYFTARRLLSQVRALDRFQVPTTEV
NAWLVHRDPEGSVSGSQPNSGLALESSSGLQDVTGPDNGVRESETEQGFG
EDLEDLGAVAPPVSGDLTKEDIDLIDILWRQDIDLGAGREVFDYSHRQKE
QDVEKELRDGGEQDTWAGEGAEALARNLLVDGETGESFPAQVPSGEDQTA
LSLEECLRLLEATCPFGENAEFPADISSITEAVPSESEPPALQNNLLSPL
LTGTESPFDLEQQWQDLMSIMEMQAMEVNTSASEILYSAPPGDPLSTNYS
LAPNTPINQNVSLHQASLGGCSQDFLLFSPEVESLPVASSSTLLPLAPSN
STSLNSTFGSTNLTGLFFPPQLNGTANDTAGPELPDPLGGLLDEAMLDEI
SLMDLAIEEGFNPVQASQLEEEFDSDSGLSLDSSHSPSSLSSSEGSSSSS
SSSSSSSSSASSSASSSFSEEGAVGYSSDSETLDLEEAEGAVGYQPEYSK
FCRMSYQDPAQLSCLPYLEHVGHNHTYNMAPSALDSADLPPPSALKKGSK
EKQADFLDKQMSRDEHRARAMKIPFTNDKIINLPVEEFNELLSKYQLSEA
QLSLIRDIRRRGKNKMAAQNCRKRKLDTILNLERDVEDLQRDKARLLREK
VEFLRSLRQMKQKVQSLYQEVFGRLRDENGRPYSPSQYALQYAGDGSVLL
IPRTMADQQARRQERKPKDRRK

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

  • Chan J.Y., Han X.-L., Kan Y.W. (1993). Cloning of Nrf1, an NF-E2-related transcription factor, by genetic selection in yeast. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 90: 11371—11375. PMID 8248256 DOI:10.1073/pnas.90.23.11371
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Caterina J.J., Donze D., Sun C.W., Ciavatta D.J., Townes T.M. (1994). Cloning and functional characterization of LCR-F1: a bZIP transcription factor that activates erythroid-specific, human globin gene expression. Nucleic Acids Res. 22: 2383—2391. PMID 8036168 DOI:10.1093/nar/22.12.2383
  • Wang W., Chan J.Y. (2006). Nrf1 is targeted to the endoplasmic reticulum membrane by an N-terminal transmembrane domain. Inhibition of nuclear translocation and transacting function. J. Biol. Chem. 281: 19676—19687. PMID 16687406 DOI:10.1074/jbc.M602802200

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7781 (англ.) . Архів оригіналу за 10 травня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
  4. UniProt, Q14494 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 17
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші