RFX4

RFX4
Ідентифікатори
Символи RFX4, NYD-SP10, regulatory factor X4
Зовнішні ІД OMIM: 603958 MGI: 1918387 HomoloGene: 31119 GeneCards: RFX4
Онтологія гена
Молекулярна функція

GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
DNA binding
GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
chromatin binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity

Клітинна компонента

клітинне ядро

Біологічний процес

GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
forebrain development
telencephalon development
dorsal spinal cord development
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
negative regulation of smoothened signaling pathway involved in ventral spinal cord patterning
cerebellar cortex morphogenesis
midbrain development
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
regulation of protein processing
transcription, DNA-templated
transcription by RNA polymerase II
cilium assembly

Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
5992
71137
Ensembl
ENSG00000111783
ENSMUSG00000020037
UniProt
Q33E94
Q7TNK1
RefSeq (мРНК)
NM_213594
NM_001206691
NM_002920
NM_032491
NM_001024918
NM_027689
RefSeq (білок)
NP_001193620
NP_115880
NP_998759
NP_001020089
NP_081965
Локус (UCSC) Хр. 12: 106.58 – 106.76 Mb Хр. 10: 84.59 – 84.74 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

RFX4 (англ. Regulatory factor X4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 735 амінокислот, а молекулярна маса — 83 368[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MHCGLLEEPDMDSTESWIERCLNESENKRYSSHTSLGNVSNDENEEKENN
RASKPHSTPATLQWLEENYEIAEGVCIPRSALYMHYLDFCEKNDTQPVNA
ASFGKIIRQQFPQLTTRRLGTRGQSKYHYYGIAVKESSQYYDVMYSKKGA
AWVSETGKKEVSKQTVAYSPRSKLGTLLPEFPNVKDLNLPASLPEEKVST
FIMMYRTHCQRILDTVIRANFDEVQSFLLHFWQGMPPHMLPVLGSSTVVN
IVGVCDSILYKAISGVLMPTVLQALPDSLTQVIRKFAKQLDEWLKVALHD
LPENLRNIKFELSRRFSQILRRQTSLNHLCQASRTVIHSADITFQMLEDW
RNVDLNSITKQTLYTMEDSRDEHRKLITQLYQEFDHLLEEQSPIESYIEW
LDTMVDRCVVKVAAKRQGSLKKVAQQFLLMWSCFGTRVIRDMTLHSAPSF
GSFHLIHLMFDDYVLYLLESLHCQERANELMRAMKGEGSTAEVREEIILT
EAAAPTPSPVPSFSPAKSATSVEVPPPSSPVSNPSPEYTGLSTTGAMQSY
TWSLTYTVTTAAGSPAENSQQLPCMRNTHVPSSSVTHRIPVYPHREEHGY
TGSYNYGSYGNQHPHPMQSQYPALPHDTAISGPLHYAPYHRSSAQYPFNS
PTSRMEPCLMSSTPRLHPTPVTPRWPEVPSANTCYTSPSVHSARYGNSSD
MYTPLTTRRNSEYEHMQHFPGFAYINGEASTGWAK

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9985 (англ.) . Архів оригіналу за 24 березня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.
  4. UniProt, Q33E94 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 12
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші