NR3C2

NR3C2
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1Y9R, 1YA3, 2A3I, 2AA2, 2AA5, 2AA6, 2AA7, 2AAX, 2AB2, 2ABI, 2OAX, 3VHU, 3VHV, 3WFF, 3WFG, 4PF3, 4TNT, 4UDB, 4UDA, 5HCV

Ідентифікатори
Символи NR3C2, MCR, MLR, MR, NR3C2VIT, nuclear receptor subfamily 3 group C member 2
Зовнішні ІД OMIM: 600983 MGI: 99459 HomoloGene: 121495 GeneCards: NR3C2
Пов'язані генетичні захворювання
autosomal dominant pseudohypoaldosteronism type 1[1]
Реагує на сполуку
Альдостерон, Кортизол, deoxycorticosterone, дексаметазон, fludrocortisone, преднізолон, Прогестерон, drospirenone, finerenone, німодипін, спіронолактон, finerenone, desoxycorticosterone pivalate, fludrocortisone acetate, desoxycorticosterone acetate[2]
Онтологія гена
Молекулярна функція

sequence-specific DNA binding
DNA binding
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
zinc ion binding
зв'язування з іоном металу
steroid hormone receptor activity
steroid binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
lipid binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific

Клітинна компонента

цитоплазма
endoplasmic reticulum membrane
мембрана
receptor complex
ендоплазматичний ретикулум
клітинне ядро
нуклеоплазма
гіалоплазма

Біологічний процес

GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
transcription, DNA-templated
transcription initiation from RNA polymerase II promoter
GO:0072468 сигнальна трансдукція
steroid hormone mediated signaling pathway
GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
positive regulation of NIK/NF-kappaB signaling

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
4306
110784
Ensembl
ENSG00000151623
ENSMUSG00000031618
UniProt
P08235
Q8VII8
RefSeq (мРНК)
NM_000901
NM_001166104
NM_001354819
NM_001083906
RefSeq (білок)
NP_000892
NP_001159576
NP_001341748
н/д
Локус (UCSC) Хр. 4: 148.08 – 148.44 Mb Хр. 8: 77.63 – 77.97 Mb
PubMed search [3] [4]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

NR3C2 (англ. Nuclear receptor subfamily 3 group C member 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. [5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 984 амінокислот, а молекулярна маса — 107 067[6].

Послідовність амінокислот
1020304050
METKGYHSLPEGLDMERRWGQVSQAVERSSLGPTERTDENNYMEIVNVSC
VSGAIPNNSTQGSSKEKQELLPCLQQDNNRPGILTSDIKTELESKELSAT
VAESMGLYMDSVRDADYSYEQQNQQGSMSPAKIYQNVEQLVKFYKGNGHR
PSTLSCVNTPLRSFMSDSGSSVNGGVMRAIVKSPIMCHEKSPSVCSPLNM
TSSVCSPAGINSVSSTTASFGSFPVHSPITQGTPLTCSPNAENRGSRSHS
PAHASNVGSPLSSPLSSMKSSISSPPSHCSVKSPVSSPNNVTLRSSVSSP
ANINNSRCSVSSPSNTNNRSTLSSPAASTVGSICSPVNNAFSYTASGTSA
GSSTLRDVVPSPDTQEKGAQEVPFPKTEEVESAISNGVTGQLNIVQYIKP
EPDGAFSSSCLGGNSKINSDSSFSVPIKQESTKHSCSGTSFKGNPTVNPF
PFMDGSYFSFMDDKDYYSLSGILGPPVPGFDGNCEGSGFPVGIKQEPDDG
SYYPEASIPSSAIVGVNSGGQSFHYRIGAQGTISLSRSARDQSFQHLSSF
PPVNTLVESWKSHGDLSSRRSDGYPVLEYIPENVSSSTLRSVSTGSSRPS
KICLVCGDEASGCHYGVVTCGSCKVFFKRAVEGQHNYLCAGRNDCIIDKI
RRKNCPACRLQKCLQAGMNLGARKSKKLGKLKGIHEEQPQQQQPPPPPPP
PQSPEEGTTYIAPAKEPSVNTALVPQLSTISRALTPSPVMVLENIEPEIV
YAGYDSSKPDTAENLLSTLNRLAGKQMIQVVKWAKVLPGFKNLPLEDQIT
LIQYSWMCLSSFALSWRSYKHTNSQFLYFAPDLVFNEEKMHQSAMYELCQ
GMHQISLQFVRLQLTFEEYTIMKVLLLLSTIPKDGLKSQAAFEEMRTNYI
KELRKMVTKCPNNSGQSWQRFYQLTKLLDSMHDLVSDLLEFCFYTFRESH
ALKVEFPAMLVEIISDQLPKVESGNAKPLYFHRK

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами, іонами металів, іоном цинку, ДНК, стероїдами. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

  • Zennaro M.-C., Souque A., Viengchareun S., Poisson E., Lombes M. (2001). A new human MR splice variant is a ligand-independent transactivator modulating corticosteroid action. Mol. Endocrinol. 15: 1586—1598. PMID 11518808 DOI:10.1210/mend.15.9.0689
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Hanukoglu A. (1991). Type I pseudohypoaldosteronism includes two clinically and genetically distinct entities with either renal or multiple target organ defects. J. Clin. Endocrinol. Metab. 73: 936—944. PMID 1939532 DOI:10.1210/jcem-73-5-936
  • Bloem L.J., Guo C., Pratt J.H. (1995). Identification of a splice variant of the rat and human mineralocorticoid receptor genes. J. Steroid Biochem. Mol. Biol. 55: 159—162. PMID 7495694 DOI:10.1016/0960-0760(95)00162-S
  • Zennaro M.-C., Farman N., Bonvalet J.-P., Lombes M. (1997). Tissue-specific expression of alpha and beta messenger ribonucleic acid isoforms of the human mineralocorticoid receptor in normal and pathological states. J. Clin. Endocrinol. Metab. 82: 1345—1352. PMID 9141514 DOI:10.1210/jcem.82.5.3933
  • Lupo B., Mesnier D., Auzou G. (1998). Cysteines 849 and 942 of human mineralocorticoid receptor are crucial for steroid binding. Biochemistry. 37: 12153—12159. PMID 9724527 DOI:10.1021/bi980593e

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з NR3C2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Сполуки, які фізично взаємодіють з NR3C2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  3. Human PubMed Reference:.
  4. Mouse PubMed Reference:.
  5. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7979 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
  6. UniProt, P08235 (англ.) . Архів оригіналу за 23 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 4
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші