ZBED9

ZBED9
Ідентифікатори
Символи ZBED9, Buster4, SCAND3, ZFP38-L, ZNF305P2, ZNF452, dJ1186N24.3, zinc finger BED-type containing 9
Зовнішні ІД OMIM: 615254 HomoloGene: 62168 GeneCards: ZBED9
Онтологія гена
Молекулярна функція

GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
nucleic acid binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
DNA binding

Клітинна компонента

цитоплазма
нуклеоплазма

Біологічний процес

GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
DNA integration
GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II

Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
114821
н/д
Ensembl
ENSG00000248496
ENSG00000232040
н/д
UniProt
Q6R2W3
н/д
RefSeq (мРНК)
NM_052923
NM_001329616
н/д
RefSeq (білок)
NP_001316545
NP_443155
н/д
Локус (UCSC) Хр. 6: 28.57 – 28.62 Mb н/д
PubMed search [1] н/д
Вікідані
Див./Ред. для людей

ZBED9 (англ. Zinc finger BED-type containing 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[2] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 325 амінокислот, а молекулярна маса — 151 666[3].

Послідовність амінокислот
1020304050
MEAVSRVFPALAGQAPEEQGEIIKVKVKEEDHTWDQESALRRNLSYTREL
SRQRFRQFCYQETPGPREALSQLRELCRQWLNPEIHTKEQILELLVLEQF
LTILPEELQSWVREHNPESGEEVVTLLEDLERELDEPRQQVSQGTYGQEV
SMEEMIPLDSAKESLGTQLQSMEDRMECESPEPHPLQDNGSFLWFSMMSQ
SMGGDNLSSLDTNEAEIEPENMREKFFRSLARLLENKSNNTKIFSKAKYC
QLIKEVKEAKAKAKKESVDYRRLARFDVILVQGNEKLIEAVNGETDKIRY
YLHSEDLFDILHNTHLSIGHGGRTRMEKELQAKYKNITKEVIMLYLTLCK
PCQQKNSKLKKVLTSKSIKEVSSRCQVDLIDMQLNPDGEYRFILHYQDLC
TKLTFLRSLKSKRPTEVAHALLDIFTIIGAPSVLQSDNGREFSSQVVSEL
SNIWPELKIVHGKSQTCQSQSSAEQTEDIRKRIFSWMQTNNSSHWTEFLW
FIQMSQNQPYHRSMQQTPCESAFSSEAKLGLSHSQLTEELVASLHTENEL
DQADKELENTLRAQYEENIETGTDSSDIEENLSVTPKVAEKSPPESRLRF
LSCVVCEKECTGVNSCISCDGNIHAICGVPSQHGTEGCGRQITCSLCYET
STMKRKHDEIQRSLPVKPSKMLKPSGTPFSPDKVGDWMAKQASLDFFVKK
RHAFSEHSSSNKRNVNNRSYPEEGKTKRVHASFTRKYDPSYIEFGFVAVI
DGEVLKPQCIICGDVLANEAMKPSKLKRHLYSKHKEISSQPKEFFERKSS
ELKSQPKQVFNVSHINISALRASYKVALPVAKSKTPYTIAETLVKDCIKE
VCLEMLGESAAKKVAQVPLSNDTIARRIQELANDMEDQLIEQIKLAKYFS
LQLDECRDIANMIILLVYVRFEHDDDIKEEFFFSASLPTNTTSSELYEAV
KNYIVNKCGLEFKFCVGVCSDGAASMTGKHSEVVTQIKELAPECKTTHCF
IHRESLAMKKISAELNSVLNDIVKIVNYIKSNSLNSRLFSLLCDNMEADH
KQLLLHAEIRWLSRGKVLSRMFEIRNELLVFLQGKKPMWSQLFKDVNWTA
RLAYLSDIFSIFNDLNASMQGKNATYFSMADKVEGQKQKLEAWKNRISTD
CYDMFHNLTTIINEVGNDLDIAHLRKVISEHLTNLLECFEFYFPSKEDPR
IGNLWIQNPFLSSKDNLNLTVTLQDKLLKLATDEGLKISFENTASLPSFW
IKAKNDYPELAEIALKLLLLFPSTYLCETGFSTLSVIKTKHRNSLNIHYP
LRVALSSIQPRLDKLTSKKQAHLSH

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Nagase T., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XXI. The complete sequences of 60 new cDNA clones from brain which code for large proteins. DNA Res. 8: 179—187. PMID 11572484 DOI:10.1093/dnares/8.4.179
  • Hayward A., Ghazal A., Andersson G., Andersson L., Jern P. (2013). ZBED evolution: repeated utilization of DNA transposons as regulators of diverse host functions. PLoS ONE. 8: E59940—E59940. PMID 23533661 DOI:10.1371/journal.pone.0059940

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13851 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
  3. UniProt, Q6R2W3 (англ.) . Архів оригіналу за 9 травня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 6
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші