SOX8

SOX8
Ідентифікатори
Символи SOX8, SRY-box 8, SRY-box transcription factor 8
Зовнішні ІД OMIM: 605923 MGI: 98370 HomoloGene: 7950 GeneCards: SOX8
Онтологія гена
Молекулярна функція

DNA binding
sequence-specific DNA binding
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
transcription factor binding
protein heterodimerization activity
RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific

Клітинна компонента

цитоплазма
клітинне ядро

Біологічний процес

positive regulation of osteoblast proliferation
cell fate commitment
negative regulation of myoblast differentiation
positive regulation of branching involved in ureteric bud morphogenesis
male gonad development
peripheral nervous system development
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
morphogenesis of a branching epithelium
ureter morphogenesis
regulation of hormone levels
oligodendrocyte differentiation
negative regulation of apoptotic process
in utero embryonic development
cell maturation
Sertoli cell development
transcription, DNA-templated
metanephric nephron tubule formation
GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated
negative regulation of photoreceptor cell differentiation
enteric nervous system development
renal vesicle induction
positive regulation of kidney development
GO:1901313 positive regulation of gene expression
retina development in camera-type eye
astrocyte fate commitment
osteoblast differentiation
neural crest cell migration
Сперматогенез
retinal rod cell differentiation
skeletal muscle cell differentiation
adipose tissue development
GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated
fat cell differentiation
GO:0072468 сигнальна трансдукція
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
positive regulation of gliogenesis
morphogenesis of an epithelium
central nervous system development

Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
30812
20681
Ensembl
ENSG00000005513
ENSMUSG00000024176
UniProt
P57073
Q04886
RefSeq (мРНК)
NM_014587
NM_011447
RefSeq (білок)
NP_055402
NP_035577
Локус (UCSC) Хр. 16: 0.98 – 0.99 Mb Хр. 17: 25.78 – 25.79 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

SOX8 (англ. SRY-box 8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 446 амінокислот, а молекулярна маса — 47 314[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MLDMSEARSQPPCSPSGTASSMSHVEDSDSDAPPSPAGSEGLGRAGVAVG
GARGDPAEAADERFPACIRDAVSQVLKGYDWSLVPMPVRGGGGGALKAKP
HVKRPMNAFMVWAQAARRKLADQYPHLHNAELSKTLGKLWRLLSESEKRP
FVEEAERLRVQHKKDHPDYKYQPRRRKSAKAGHSDSDSGAELGPHPGGGA
VYKAEAGLGDGHHHGDHTGQTHGPPTPPTTPKTELQQAGAKPELKLEGRR
PVDSGRQNIDFSNVDISELSSEVMGTMDAFDVHEFDQYLPLGGPAPPEPG
QAYGGAYFHAGASPVWAHKSAPSASASPTETGPPRPHIKTEQPSPGHYGD
QPRGSPDYGSCSGQSSATPAAPAGPFAGSQGDYGDLQASSYYGAYPGYAP
GLYQYPCFHSPRRPYASPLLNGLALPPAHSPTSHWDQPVYTTLTRP

Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Pfeifer D., Poulat F., Holinski-Feder E., Kooy F., Scherer G. (2000). The SOX8 gene is located within 700 kb of the tip of chromosome 16p and is deleted in a patient with ATR-16 syndrome. Genomics. 63: 108—116. PMID 10662550 DOI:10.1006/geno.1999.6060

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11203 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
  4. UniProt, P57073 (англ.) . Архів оригіналу за 13 березня 2018. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 16
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші