JUNB

JUNB
Ідентифікатори
Символи JUNB, AP-1, JunB proto-oncogene, AP-1 transcription factor subunit
Зовнішні ІД OMIM: 165161 MGI: 96647 HomoloGene: 7390 GeneCards: JUNB
Онтологія гена
Молекулярна функція

DNA binding
RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0001106 transcription corepressor activity
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
GO:0001105 transcription coactivator activity
GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
transcription factor binding
GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific

Клітинна компонента

нуклеоплазма
Хроматин
клітинне ядро
transcription factor AP-1 complex
transcription regulator complex

Біологічний процес

cellular response to calcium ion
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
regulation of cell death
osteoclast differentiation
labyrinthine layer blood vessel development
in utero embryonic development
GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
transcription by RNA polymerase II
regulation of cell cycle
васкулогенез
embryonic process involved in female pregnancy
response to lipopolysaccharide
decidualization
regulation of cell population proliferation
trophectodermal cell differentiation
osteoblast differentiation
positive regulation of cell differentiation
response to radiation
osteoblast proliferation
GO:0006928 клітинний процес
response to cAMP
response to mechanical stimulus
transcription, DNA-templated
cellular response to hormone stimulus
response to cytokine
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
cytokine-mediated signaling pathway
response to organic substance

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
3726
16477
Ensembl
ENSG00000171223
ENSMUSG00000052837
UniProt
P17275
P09450
RefSeq (мРНК)
NM_002229
NM_008416
RefSeq (білок)
NP_002220
NP_032442
Локус (UCSC) Хр. 19: 12.79 – 12.79 Mb Хр. 8: 85.7 – 85.71 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

JUNB (англ. JunB proto-oncogene, AP-1 transcription factor subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 347 амінокислот, а молекулярна маса — 35 879[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MCTKMEQPFYHDDSYTATGYGRAPGGLSLHDYKLLKPSLAVNLADPYRSL
KAPGARGPGPEGGGGGSYFSGQGSDTGASLKLASSELERLIVPNSNGVIT
TTPTPPGQYFYPRGGGSGGGAGGAGGGVTEEQEGFADGFVKALDDLHKMN
HVTPPNVSLGATGGPPAGPGGVYAGPEPPPVYTNLSSYSPASASSGGAGA
AVGTGSSYPTTTISYLPHAPPFAGGHPAQLGLGRGASTFKEEPQTVPEAR
SRDATPPVSPINMEDQERIKVERKRLRNRLAATKCRKRKLERIARLEDKV
KTLKAENAGLSSTAGLLREQVAQLKQKVMTHVSNGCQLLLGVKGHAF

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • Phinney D.G., Tseng S.W., Ryder K. (1995). Complex genetic organization of junB: multiple blocks of flanking evolutionarily conserved sequence at the murine and human junB loci. Genomics. 28: 228—234. PMID 8530030 DOI:10.1006/geno.1995.1135
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111
  • Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6205 (англ.) . Архів оригіналу за 25 липня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
  4. UniProt, P17275 (англ.) . Архів оригіналу за 24 липня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 19
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші