TEAD1

TEAD1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

2HZD, 3KYS, 4RE1, 4Z8E

Ідентифікатори
Символи TEAD1, AA, NTEF-1, REF1, TCF-13, TCF13, TEAD-1, TEF-1, TEA domain transcription factor 1
Зовнішні ІД OMIM: 189967 MGI: 101876 HomoloGene: 2418 GeneCards: TEAD1
Онтологія гена
Молекулярна функція

GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
DNA binding
transcription factor activity, RNA polymerase II core promoter proximal region sequence-specific binding
transcription coactivator binding
sequence-specific DNA binding
protein heterodimerization activity
GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific

Клітинна компонента

клітинне ядро
нуклеоплазма
transcription regulator complex

Біологічний процес

GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
hippo signaling
transcription, DNA-templated
transcription initiation from RNA polymerase II promoter
positive regulation of pri-miRNA transcription by RNA polymerase II
GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated
embryonic organ development
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
GO:0034622 protein-containing complex assembly

Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
7003
21676
Ensembl
ENSG00000187079
ENSMUSG00000055320
UniProt
P28347
P30051
RefSeq (мРНК)
NM_021961
NM_001166584
NM_001166585
NM_009346
NM_175559
RefSeq (білок)
NP_068780
NP_001160056
NP_001160057
NP_033372
Локус (UCSC) Хр. 11: 12.67 – 12.94 Mb Хр. 7: 112.28 – 112.51 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

TEAD1 (англ. TEA domain transcription factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 426 амінокислот, а молекулярна маса — 47 946[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MEPSSWSGSESPAENMERMSDSADKPIDNDAEGVWSPDIEQSFQEALAIY
PPCGRRKIILSDEGKMYGRNELIARYIKLRTGKTRTRKQVSSHIQVLARR
KSRDFHSKLKDQTAKDKALQHMAAMSSAQIVSATAIHNKLGLPGIPRPTF
PGAPGFWPGMIQTGQPGSSQDVKPFVQQAYPIQPAVTAPIPGFEPASAPA
PSVPAWQGRSIGTTKLRLVEFSAFLEQQRDPDSYNKHLFVHIGHANHSYS
DPLLESVDIRQIYDKFPEKKGGLKELFGKGPQNAFFLVKFWADLNCNIQD
DAGAFYGVTSQYESSENMTVTCSTKVCSFGKQVVEKVETEYARFENGRFV
YRINRSPMCEYMINFIHKLKHLPEKYMMNSVLENFTILLVVTNRDTQETL
LCMACVFEVSNSEHGAQHHIYRLVKD

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • Xiao J.H., Davidson I., Matthes H., Garnier J.-M., Chambon P. (1991). Cloning, expression, and transcriptional properties of the human enhancer factor TEF-1. Cell. 65: 551—568. PMID 1851669 DOI:10.1016/0092-8674(91)90088-G
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Buerglin T.R. (1991). The TEA domain: a novel, highly conserved DNA-binding motif. Cell. 66: 11—12. PMID 2070413 DOI:10.1016/0092-8674(91)90132-I

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11714 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
  4. UniProt, P28347 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 11
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші