DLX1

DLX1
Ідентифікатори
Символи DLX1, Dlx, Dlx-1, distal-less homeobox 1
Зовнішні ІД OMIM: 600029 MGI: 94901 HomoloGene: 22558 GeneCards: DLX1
Онтологія гена
Молекулярна функція

DNA binding
sequence-specific DNA binding
RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
chromatin binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity

Клітинна компонента

клітинне ядро

Біологічний процес

GO:1904089 negative regulation of neuron apoptotic process
cerebral cortex GABAergic interneuron differentiation
proximal/distal pattern formation
диференціація клітин
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
embryonic skeletal system development
multicellular organism development
odontogenesis of dentin-containing tooth
cerebral cortex GABAergic interneuron fate commitment
negative regulation of oligodendrocyte differentiation
forebrain neuron differentiation
hippocampus development
subpallium development
negative regulation of Notch signaling pathway
positive regulation of cell differentiation
negative regulation of photoreceptor cell differentiation
positive regulation of amacrine cell differentiation
GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
negative regulation of BMP signaling pathway
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
cellular response to transforming growth factor beta stimulus
cellular response to BMP stimulus
negative regulation of cellular response to transforming growth factor beta stimulus
transcription, DNA-templated

Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
1745
13390
Ensembl
ENSG00000144355
ENSMUSG00000041911
UniProt
P56177
Q64317
RefSeq (мРНК)
NM_001038493
NM_178120
NM_010053
RefSeq (білок)
NP_001033582
NP_835221
NP_034183
Локус (UCSC) Хр. 2: 172.08 – 172.09 Mb Хр. 2: 71.36 – 71.36 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

DLX1 (англ. Distal-less homeobox 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 255 амінокислот, а молекулярна маса — 27 320[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MTMTTMPESLNSPVSGKAVFMEFGPPNQQMSPSPMSHGHYSMHCLHSAGH
SQPDGAYSSASSFSRPLGYPYVNSVSSHASSPYISSVQSYPGSASLAQSR
LEDPGADSEKSTVVEGGEVRFNGKGKKIRKPRTIYSSLQLQALNRRFQQT
QYLALPERAELAASLGLTQTQVKIWFQNKRSKFKKLMKQGGAALEGSALA
NGRALSAGSPPVPPGWNPNSSSGKGSGGNAGSYIPSYTSWYPSAHQEAMQ
QPQLM

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2914 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
  4. UniProt, P56177 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 2
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші