CEBPA

CEBPA
Ідентифікатори
Символи CEBPA, C/EBP-alpha, CEBP, CCAAT/enhancer binding protein alpha, CCAAT enhancer binding protein alpha
Зовнішні ІД OMIM: 116897 MGI: 99480 HomoloGene: 3211 GeneCards: CEBPA
Пов'язані генетичні захворювання
гострий мієлоїдний лейкоз[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

DNA binding
sequence-specific DNA binding
protein homodimerization activity
GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
GO:0001105 transcription coactivator activity
transcription factor binding
GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
kinase binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific

Клітинна компонента

transcription regulator complex
RNA polymerase II transcription regulator complex
ядерце
клітинне ядро
нуклеоплазма
внутрішньоклітинна мембранна органела

Біологічний процес

Сигнальний шлях Notch
transcription by RNA polymerase I
myeloid cell differentiation
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
cellular response to lithium ion
glucose homeostasis
negative regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity
lung development
cytokine-mediated signaling pathway
цикл сечовини
GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
GO:1904579 cellular response to organic cyclic compound
mitochondrion organization
embryonic placenta development
cholesterol metabolic process
negative regulation of cell cycle
GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
cell maturation
generation of precursor metabolites and energy
transcription, DNA-templated
macrophage differentiation
multicellular organism development
GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated
positive regulation of osteoblast differentiation
granulocyte differentiation
regulation of cell population proliferation
brown fat cell differentiation
lipid homeostasis
white fat cell differentiation
inner ear development
liver development
GO:0022415 viral process
GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated
positive regulation of fat cell differentiation
positive regulation of transcription by RNA polymerase III
fat cell differentiation
positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
negative regulation of cell population proliferation
transcription by RNA polymerase II
cellular response to tumor necrosis factor
positive regulation of DNA-templated transcription, initiation
positive regulation of macrophage activation
positive regulation of inflammatory response
interleukin-6-mediated signaling pathway

Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
1050
12606
Ensembl
ENSG00000245848
ENSMUSG00000034957
UniProt
P49715
P53566
RefSeq (мРНК)
NM_004364
NM_001285829
NM_001287424
NM_001287435
NM_001287514
NM_001287515
NM_001287521
NM_001287523
NM_007678
RefSeq (білок)
NP_001272758
NP_001274353
NP_001274364
NP_004355
NP_001274443
NP_001274444
NP_001274450
NP_001274452
NP_031704
Локус (UCSC) Хр. 19: 33.3 – 33.3 Mb Хр. 7: 34.82 – 34.82 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

CEBPA (англ. CCAAT/enhancer binding protein alpha) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 358 амінокислот, а молекулярна маса — 37 561[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MESADFYEAEPRPPMSSHLQSPPHAPSSAAFGFPRGAGPAQPPAPPAAPE
PLGGICEHETSIDISAYIDPAAFNDEFLADLFQHSRQQEKAKAAVGPTGG
GGGGDFDYPGAPAGPGGAVMPGGAHGPPPGYGCAAAGYLDGRLEPLYERV
GAPALRPLVIKQEPREEDEAKQLALAGLFPYQPPPPPPPSHPHPHPPPAH
LAAPHLQFQIAHCGQTTMHLQPGHPTPPPTPVPSPHPAPALGAAGLPGPG
SALKGLGAAHPDLRASGGSGAGKAKKSVDKNSNEYRVRRERNNIAVRKSR
DKAKQRNVETQQKVLELTSDNDRLRKRVEQLSRELDTLRGIFRQLPESSL
VKAMGNCA

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • Antonson P., Xanthopoulos K.G. (1995). Molecular cloning, sequence, and expression patterns of the human gene encoding CCAAT/enhancer binding protein alpha (C/EBP alpha). Biochem. Biophys. Res. Commun. 215: 106—113. PMID 7575576 DOI:10.1006/bbrc.1995.2439
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Choi B.H., Park G.T., Rho H.M. (1999). Interaction of hepatitis B viral X protein and CCAAT/enhancer-binding protein alpha synergistically activates the hepatitis B viral enhancer II/pregenomic promoter. J. Biol. Chem. 274: 2858—2865. PMID 9915821 DOI:10.1074/jbc.274.5.2858
  • Wang G.L., Iakova P., Wilde M., Awad S., Timchenko N.A. (2004). Liver tumors escape negative control of proliferation via PI3K/Akt-mediated block of C/EBP alpha growth inhibitory activity. Genes Dev. 18: 912—925. PMID 15107404 DOI:10.1101/gad.1183304
  • Muller C., Calkhoven C.F., Sha X., Leutz A. (2004). The CCAAT enhancer-binding protein alpha (C/EBPalpha) requires a SWI/SNF complex for proliferation arrest. J. Biol. Chem. 279: 7353—7358. PMID 14660596 DOI:10.1074/jbc.M312709200
  • Smith M.L., Cavenagh J.D., Lister T.A., Fitzgibbon J. (2004). Mutation of CEBPA in familial acute myeloid leukemia. N. Engl. J. Med. 351: 2403—2407. PMID 15575056 DOI:10.1056/NEJMoa041331

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з CEBPA переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1833 (англ.) . Архів оригіналу за 31 липня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
  5. UniProt, P49715 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 19
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші