LMX1A

LMX1A
Ідентифікатори
Символи LMX1A, LMX1, LMX1.1, LIM homeobox transcription factor 1 alpha, DFNA7
Зовнішні ІД OMIM: 600298 MGI: 1888519 HomoloGene: 24921 GeneCards: LMX1A
Онтологія гена
Молекулярна функція

GO:0001948, GO:0016582 protein binding
DNA binding
sequence-specific DNA binding
зв'язування з іоном металу
RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific

Клітинна компонента

клітинне ядро

Біологічний процес

neuron differentiation
cerebellum development
multicellular organism development
midbrain development
central nervous system development
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
axon guidance
dentate gyrus development
transcription, DNA-templated
negative regulation of neuron differentiation
central nervous system neuron differentiation
hippocampus development
regulation of cell growth
brain development
dopaminergic neuron differentiation
регуляція експресії генів
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
synapse organization
olfactory behavior
пам'ять
locomotory behavior
midbrain dopaminergic neuron differentiation
transcription by RNA polymerase II

Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
4009
110648
Ensembl
ENSG00000162761
ENSMUSG00000026686
UniProt
Q8TE12
Q9JKU8
RefSeq (мРНК)
NM_001033507
NM_001174069
NM_177398
NM_177399
NM_033652
RefSeq (білок)
NP_001167540
NP_796372
NP_387501
Локус (UCSC) Хр. 1: 165.2 – 165.36 Mb Хр. 1: 167.52 – 167.68 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

LMX1A (англ. LIM homeobox transcription factor 1 alpha) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 382 амінокислот, а молекулярна маса — 42 747[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MLDGLKMEENFQSAIDTSASFSSLLGRAVSPKSVCEGCQRVILDRFLLRL
NDSFWHEQCVQCASCKEPLETTCFYRDKKLYCKYDYEKLFAVKCGGCFEA
IAPNEFVMRAQKSVYHLSCFCCCVCERQLQKGDEFVLKEGQLLCKGDYEK
ERELLSLVSPAASDSGKSDDEESLCKSAHGAGKGTAEEGKDHKRPKRPRT
ILTTQQRRAFKASFEVSSKPCRKVRETLAAETGLSVRVVQVWFQNQRAKM
KKLARRQQQQQQDQQNTQRLSSAQTNGGGSAGMEGIMNPYTALPTPQQLL
AIEQSVYSSDPFRQGLTPPQMPGDHMHPYGAEPLFHDLDSDDTSLSNLGD
CFLATSEAGPLQSRVGNPIDHLYSMQNSYFTS

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6653 (англ.) . Архів оригіналу за 22 березня 2016. Процитовано 25 серпня 2017.
  4. UniProt, Q8TE12 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 1
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші