FOXJ1

FOXJ1
Ідентифікатори
Символи FOXJ1, FKHL13, HFH-4, HFH4, forkhead box J1, CILD43
Зовнішні ІД OMIM: 602291 MGI: 1347474 HomoloGene: 1117 GeneCards: FOXJ1
Онтологія гена
Молекулярна функція

GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding
GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
sequence-specific DNA binding
DNA binding
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific

Клітинна компонента

клітинне ядро

Біологічний процес

determination of left/right symmetry
positive regulation of lung ciliated cell differentiation
cell projection organization
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
metanephric part of ureteric bud development
pattern specification process
transcription, DNA-templated
glomerular parietal epithelial cell development
regulation of epithelial cell differentiation
transcription by RNA polymerase II
negative regulation of T cell proliferation
left/right pattern formation
Сперматогенез
heart development
negative regulation of T cell differentiation in thymus
cilium assembly
establishment of apical/basal cell polarity
GO:0032861, GO:0032862, GO:0032856 activation of GTPase activity
negative regulation of B cell activation
positive regulation of central B cell tolerance induction
GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
epithelium development
negative regulation of humoral immune response mediated by circulating immunoglobulin
brain development
humoral immune response
negative regulation of germinal center formation
central tolerance induction
negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity
lung epithelium development
actin cytoskeleton organization
leukocyte migration
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
motile cilium assembly
GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated

Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
2302
15223
Ensembl
ENSG00000129654
ENSMUSG00000034227
UniProt
Q92949
Q61660
RefSeq (мРНК)
NM_001454
NM_008240
RefSeq (білок)
NP_001445
NP_032266
Локус (UCSC) Хр. 17: 76.14 – 76.14 Mb Хр. 11: 116.22 – 116.23 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

FOXJ1 (англ. Forkhead box J1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 421 амінокислот, а молекулярна маса — 45 247[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MAESWLRLSGAGPAEEAGPEGGLEEPDALDDSLTSLQWLQEFSILNAKAP
ALPPGGTDPHGYHQVPGSAAPGSPLAADPACLGQPHTPGKPTSSCTSRSA
PPGLQAPPPDDVDYATNPHVKPPYSYATLICMAMQASKATKITLSAIYKW
ITDNFCYFRHADPTWQNSIRHNLSLNKCFIKVPREKDEPGKGGFWRIDPQ
YAERLLSGAFKKRRLPPVHIHPAFARQAAQEPSAVPRAGPLTVNTEAQQL
LREFEEATGEAGWGAGEGRLGHKRKQPLPKRVAKVPRPPSTLLPTPEEQG
ELEPLKGNFDWEAIFDAGTLGGELGALEALELSPPLSPASHVDVDLTIHG
RHIDCPATWGPSVEQAADSLDFDETFLATSFLQHPWDESGSGCLPPEPLF
EAGDATLASDLQDWASVGAFL

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, біогенез та деградація війок. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Li C.-S., Chae S.-C., Lee J.-H., Zhang Q., Chung H.-T. (2006). Identification of single nucleotide polymorphisms in FOXJ1 and their association with allergic rhinitis. J. Hum. Genet. 51: 292—297. PMID 16518568 DOI:10.1007/s10038-006-0359-8
  • Pelletier G.J., Brody S.L., Liapis H., White R.A., Hackett B.P. (1998). A human forkhead/winged-helix transcription factor expressed in developing pulmonary and renal epithelium. Am. J. Physiol. 274: L351—L359. PMID 9530170

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3816 (англ.) . Архів оригіналу за 31 липня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
  4. UniProt, Q92949 (англ.) . Архів оригіналу за 3 грудня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 17
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші