MAFB

MAFB
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

2WT7, 2WTY, 4AUW

Ідентифікатори
Символи MAFB, KRML, MCTO, MAF bZIP transcription factor B, DURS3
Зовнішні ІД OMIM: 608968 MGI: 104555 HomoloGene: 31315 GeneCards: MAFB
Пов'язані генетичні захворювання
multicentric carpo-tarsal osteolysis with or without nephropathy[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

DNA binding
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
transcription factor binding
GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
protein homodimerization activity
protein heterodimerization activity
sequence-specific double-stranded DNA binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
sequence-specific DNA binding

Клітинна компонента

transcription regulator complex
клітинне ядро

Біологічний процес

T cell differentiation in thymus
negative regulation of osteoclast differentiation
brain segmentation
thymus development
transcription by RNA polymerase II
respiratory gaseous exchange by respiratory system
segment specification
negative regulation of erythrocyte differentiation
нейробіологія розвитку
transcription, DNA-templated
rhombomere 6 development
rhombomere 5 development
inner ear morphogenesis
sensory organ development
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
abducens nerve formation
GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
9935
16658
Ensembl
ENSG00000204103
ENSMUSG00000074622
UniProt
Q9Y5Q3
P54841
RefSeq (мРНК)
NM_005461
NM_010658
RefSeq (білок)
NP_005452
NP_034788
Локус (UCSC) Хр. 20: 40.69 – 40.69 Mb Хр. 2: 160.21 – 160.21 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

MAFB (англ. MAF bZIP transcription factor B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 323 амінокислот, а молекулярна маса — 35 792[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MAAELSMGPELPTSPLAMEYVNDFDLLKFDVKKEPLGRAERPGRPCTRLQ
PAGSVSSTPLSTPCSSVPSSPSFSPTEQKTHLEDLYWMASNYQQMNPEAL
NLTPEDAVEALIGSHPVPQPLQSFDSFRGAHHHHHHHHPHPHHAYPGAGV
AHDELGPHAHPHHHHHHQASPPPSSAASPAQQLPTSHPGPGPHATASATA
AGGNGSVEDRFSDDQLVSMSVRELNRHLRGFTKDEVIRLKQKRRTLKNRG
YAQSCRYKRVQQKHHLENEKTQLIQQVEQLKQEVSRLARERDAYKVKCEK
LANSGFREAGSTSDSPSSPEFFL

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Eychene A., Rocques N., Pouponnot C. (2008). A new MAFia in cancer. Nat. Rev. Cancer. 8: 683—693. PMID 19143053 DOI:10.1038/nrc2460

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з MAFB переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6408 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
  5. UniProt, Q9Y5Q3 (англ.) . Архів оригіналу за 20 жовтня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 20
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші