E2F4

E2F4
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1CF7

Ідентифікатори
Символи E2F4, E2F-4, E2F transcription factor 4
Зовнішні ІД OMIM: 600659 MGI: 103012 HomoloGene: 1471 GeneCards: E2F4
Онтологія гена
Молекулярна функція

DNA binding
protein domain specific binding
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
transcription factor binding
GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
promoter-specific chromatin binding
protein dimerization activity
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific
sequence-specific DNA binding

Клітинна компонента

transcription regulator complex
нуклеоплазма
клітинне ядро
RNA polymerase II transcription regulator complex

Біологічний процес

regulation of cell size
epithelial cell development
cell volume homeostasis
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
multi-ciliated epithelial cell differentiation
transcription by RNA polymerase II
regulation of transcription involved in G1/S transition of mitotic cell cycle
кровообіг
cell projection organization
regulation of cell population proliferation
animal organ morphogenesis
клітинний цикл
motile cilium assembly
centriole assembly
transcription, DNA-templated
GO:0007067 мітоз
DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
cilium assembly
GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
regulation of cell cycle

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
1874
104394
Ensembl
ENSG00000205250
ENSMUSG00000014859
UniProt
Q16254
Q8R0K9
RefSeq (мРНК)
NM_001950
NM_148952
RefSeq (білок)
NP_001941
NP_683754
Локус (UCSC) Хр. 16: 67.19 – 67.2 Mb Хр. 8: 106.02 – 106.03 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

E2F4 (англ. E2F transcription factor 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 413 амінокислот, а молекулярна маса — 43 960[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MAEAGPQAPPPPGTPSRHEKSLGLLTTKFVSLLQEAKDGVLDLKLAADTL
AVRQKRRIYDITNVLEGIGLIEKKSKNSIQWKGVGPGCNTREIADKLIEL
KAEIEELQQREQELDQHKVWVQQSIRNVTEDVQNSCLAYVTHEDICRCFA
GDTLLAIRAPSGTSLEVPIPEGLNGQKKYQIHLKSVSGPIEVLLVNKEAW
SSPPVAVPVPPPEDLLQSPSAVSTPPPLPKPALAQSQEASRPNSPQLTPT
AVPGSAEVQGMAGPAAEITVSGGPGTDSKDSGELSSLPLGPTTLDTRPLQ
SSALLDSSSSSSSSSSSSSNSNSSSSSGPNPSTSFEPIKADPTGVLELPK
ELSEIFDPTRECMSSELLEELMSSEVFAPLLRLSPPPGDHDYIYNLDESE
GVCDLFDVPVLNL

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, клітинний цикл, біогенез та деградація війок, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • Schwemmle S., Pfeifer G.P. (2000). Genomic structure and mutation screening of the E2F4 gene in human tumors. Int. J. Cancer. 86: 672—677. PMID 10797289 DOI:10.1002/(SICI)1097-0215(20000601)86:5<672::AID-IJC11>3.0.CO;2-X
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Williams C.D., Linch D.C., Soerensen T.S., La Thangue N.B., Thomas N.S.B. (1997). The predominant E2F complex in human primary haemopoietic cells and in AML blasts contains E2F-4, DP-1 and p130. Br. J. Haematol. 96: 688—696. PMID 9074408 DOI:10.1046/j.1365-2141.1997.d01-2086.x
  • Lang S.E., McMahon S.B., Cole M.D., Hearing P. (2001). E2F transcriptional activation requires TRRAP and GCN5 cofactors. J. Biol. Chem. 276: 32627—32634. PMID 11418595 DOI:10.1074/jbc.M102067200
  • Luciano R.L., Wilson A.C. (2003). HCF-1 functions as a coactivator for the zinc finger protein Krox20. J. Biol. Chem. 278: 51116—51124. PMID 14532282 DOI:10.1074/jbc.M303470200
  • Wang G.L., Iakova P., Wilde M., Awad S., Timchenko N.A. (2004). Liver tumors escape negative control of proliferation via PI3K/Akt-mediated block of C/EBP alpha growth inhibitory activity. Genes Dev. 18: 912—925. PMID 15107404 DOI:10.1101/gad.1183304

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3118 (англ.) . Архів оригіналу за 15 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
  4. UniProt, Q16254 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 16
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші