RBL1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1H28, 4YOO, 4YOS, 4YOZ

Ідентифікатори

Символи

RBL1, CP107, PRB1, p107, retinoblastoma-like 1, RB transcriptional corepressor like 1

Зовнішні ІД

OMIM: 116957 MGI: 103300 HomoloGene: 2172 GeneCards: RBL1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• transcription factor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • promoter-specific chromatin binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	• клітинне ядро • transcription regulator complex • нуклеоплазма • Хроматин
Біологічний процес	• regulation of cell cycle • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • клітинний цикл • GO:0022415 viral process • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of lipid kinase activity • negative regulation of gene expression • transcription, DNA-templated • negative regulation of cellular senescence • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • regulation of mitotic cell cycle • диференціація клітин • regulation of cell division • GO:1990376 negative regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


5933


19650

Ensembl


ENSG00000080839


ENSMUSG00000027641

UniProt


P28749


Q64701

RefSeq (мРНК)


NM_002895 NM_183404 NM_001323281 NM_001323282


NM_001139516 NM_011249

RefSeq (білок)


NP_001310210 NP_001310211 NP_002886 NP_899662


NP_001132988 NP_035379

Локус (UCSC)

Хр. 20: 37 – 37.1 Mb

Хр. 2: 156.99 – 157.05 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RBL1 (англ. RB transcriptional corepressor like 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 068 амінокислот, а молекулярна маса — 120 847^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MFEDKPHAEG	AAVVAAAGEA	LQALCQELNL	DEGSAAEALD	DFTAIRGNYS
LEGEVTHWLA	CSLYVACRKS	IIPTVGKGIM	EGNCVSLTRI	LRSAKLSLIQ
FFSKMKKWMD	MSNLPQEFRE	RIERLERNFE	VSTVIFKKYE	PIFLDIFQNP
YEEPPKLPRS	RKQRRIPCSV	KDLFNFCWTL	FVYTKGNFRM	IGDDLVNSYH
LLLCCLDLIF	ANAIMCPNRQ	DLLNPSFKGL	PSDFHTADFT	ASEEPPCIIA
VLCELHDGLL	VEAKGIKEHY	FKPYISKLFD	RKILKGECLL	DLSSFTDNSK
AVNKEYEEYV	LTVGDFDERI	FLGADAEEEI	GTPRKFTRDT	PLGKLTAQAN
VEYNLQQHFE	KKRSFAPSTP	LTGRRYLREK	EAVITPVASA	TQSVSRLQSI
VAGLKNAPSD	QLINIFESCV	RNPVENIMKI	LKGIGETFCQ	HYTQSTDEQP
GSHIDFAVNR	LKLAEILYYK	ILETVMVQET	RRLHGMDMSV	LLEQDIFHRS
LMACCLEIVL	FAYSSPRTFP	WIIEVLNLQP	FYFYKVIEVV	IRSEEGLSRD
MVKHLNSIEE	QILESLAWSH	DSALWEALQV	SANKVPTCEE	VIFPNNFETG
NGGNVQGHLP	LMPMSPLMHP	RVKEVRTDSG	SLRRDMQPLS	PISVHERYSS
PTAGSAKRRL	FGEDPPKEML	MDKIITEGTK	LKIAPSSSIT	AENVSILPGQ
TLLTMATAPV	TGTTGHKVTI	PLHGVANDAG	EITLIPLSMN	TNQESKVKSP
VSLTAHSLIG	ASPKQTNLTK	AQEVHSTGIN	RPKRTGSLAL	FYRKVYHLAS
VRLRDLCLKL	DVSNELRRKI	WTCFEFTLVH	CPDLMKDRHL	DQLLLCAFYI
MAKVTKEERT	FQEIMKSYRN	QPQANSHVYR	SVLLKSIPRE	VVAYNKNIND
DFEMIDCDLE	DATKTPDCSS	GPVKEERGDL	IKFYNTIYVG	RVKSFALKYD
LANQDHMMDA	PPLSPFPHIK	QQPGSPRRIS	QQHSIYISPH	KNGSGLTPRS
ALLYKFNGSP	SKSLKDINNM	IRQGEQRTKK	RVIAIDSDAE	SPAKRVCQEN
DDVLLKRLQD	VVSERANH

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, клітинний цикл, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Ewen M.E., Xing Y., Lawrence J.B., Livingston D.M. (1991). Molecular cloning, chromosomal mapping, and expression of the cDNA for p107, a retinoblastoma gene product-related protein. Cell. 66: 1155—1164. PMID 1833063 DOI:10.1016/0092-8674(91)90038-Z
Zhu L., Zhu L., Xie E., Chang L.S. (1995). Differential roles of two tandem E2F sites in repression of the human p107 promoter by retinoblastoma and p107 proteins. Mol. Cell. Biol. 15: 3552—3562. PMID 7791762 DOI:10.1128/MCB.15.7.3552
Leng X., Noble M., Adams P.D., Qin J., Harper J.W. (2002). Reversal of growth suppression by p107 via direct phosphorylation by cyclin D1/cyclin-dependent kinase 4. Mol. Cell. Biol. 22: 2242—2254. PMID 11884610 DOI:10.1128/MCB.22.7.2242-2254.2002
Dyson N., Buchkovich K., Whyte P., Harlow E. (1989). The cellular 107K protein that binds to adenovirus E1A also associates with the large T antigens of SV40 and JC virus. Cell. 58: 249—255. PMID 2546678 DOI:10.1016/0092-8674(89)90839-8
Kim Y.W., Otterson G.A., Kratzke R.A., Coxon A.B., Kaye F.J. (1994). Differential specificity for binding of retinoblastoma binding protein 2 to RB, p107, and TATA-binding protein. Mol. Cell. Biol. 14: 7256—7264. PMID 7935440 DOI:10.1128/MCB.14.11.7256

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9893 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, P28749 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 20

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори

(1) Основні домени

(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)	Фактори актривації транскрипції AATF 1 2 3 4 5 6 7 AP-1 c-Fos FOSB FOSL1 FOSL2 JDP2 c-Jun JUNB JUND BACH 1 2 BATF BLZF1 C/EBP α β γ δ ε ζ CREB 1 3 L1 CREM DBP DDIT3 GABPA GCN4 HLF MAF B F G K NFE 2 L1 L2 L3 NFIL3 NRL NRF 1 2 3 XBP1

(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)	ATOH1 AHR AHRR ARNT ASCL1 BHLH 2 3 9 ARNTL ARNTL ARNTL2 CLOCK EPAS1 FIGLA HAND 1 2 HES 5 6 HEY 1 2 L HES1 HIF 1A 3A ID 1 2 3 4 LYL1 MESP2 MXD4 MYCL MYCN Міогенні фактори MyoD MYOG MYF5 MYF6 Нейрогеніни 1 2 3 НейроD 1 2 NPAS 1 2 3 OLIG 1 2 SIM 1 2 TAL 1 2 TWIST1 USF1

(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)	AP-4 MAX MXD1 MXD3 MITF MNT MLX MLXIPL MXI1 Myc SREBP 1 2

(1.4) NF-1	NFI A B C X SMAD R-SMAD 1 2 3 5 9 I-SMAD 6 7 4)

(1.5) RF-X	RFX 1 2 3 4 5 6 ANK

(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)	AP-2 α β γ δ ε

(2) Цинк-координовані домени ДНК

(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys₄)

підродина 1	Тиреоїдний гормон α β CAR FXR LXR α β PPAR α β/δ γ PXR RAR α β γ ROR α β γ Rev-ErbA α β VDR

підродина 2	COUP-TF I II Ear-2 HNF4 α γ PNR RXR α β γ Тестикулярні рецептори 2 4 TLX

підродина 3	Стероїдні гормони Андроген Естроген α β Глюкокортикоїди Мінералокортикоїди Прогестерон Естроген-зв'язувальні α β γ

підродина 4	NUR NGFIB NOR1 NURR1

підродина 5	LRH-1 SF1

підродина 6	GCNF

підродина 0	DAX1 SHP

(2.2) Інші цинкові пальці Cys₄

GATA
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
MTA
- 1
- 2
- 3
TRPS1

(2.3) Cys₂His₂ з доменом цинкових пальців

Загальні фактори транскрипції
- TFIIA
  - 1
  - 2
- TFIIB
- TFIID
  - TBP
    - L1
    - L2
  - TAF
    - 1
    - 2
    - 3
    - 4
    - 4B
    - 5
    - 6
    - 7
    - 8
    - 9
    - 9B
    - 10
    - 11
    - 12
    - 13
    - 15
- TFIIE
  - 1
  - 2
- TFIIF
  - 1
  - 2
- TFIIH
  - 1
  - 2
  - 4
  - 2I
  - 3A
  - 3C1
  - 3C2

ATBF1
BCL
- 1
- 2
- 3
- 5
- 6
- 6B
- 7A
- 7B
- 7C
- 8
- 9
- 10
- 11A
- 11B
CTCF
E4F1
EGR
- 1
- 2
- 3
- 4
ERV3
GFI1
GLI
- 1
- 2
- 3
- REST
- S1
- S2
- YY1
HIC
- 1
- 2
HIVEP
- 1
- 2
- 3
IKZF
- 1
- 2
- 3
ILF
- 2
- 3
KLF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
- 10
- 11
- 12
- 13
- 14
- 15
- 17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
SALL
- 1
- 2
- 3
- 4
SP
- 1
- 2
- 4
- 7
- 8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
- 7A
- 7B
ZBTB
- 11
- 16
- 17
- 20
- 32
- 33
- 40
цинкові пальці
- 3
- 7
- 9
- 10
- 19
- 22
- 24
- 33B
- 34
- 35
- 41
- 43
- 44
- 51
- 74
- 143
- 146
- 148
- 165
- 202
- 217
- 219
- 238
- 239
- 259
- 267
- 268
- 281
- 295
- 300
- 318
- 330
- 346
- 350
- 365
- 366
- 384
- 423
- 451
- 452
- 471
- 593
- 638
- 644
- 649
- 655

(2.4) Cys₆ цистеїн-цинковий кластер

HIVEP1

(2.5) Цинкові пальці іншого складу

AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
JARID
- 1A
- 1B
- 1C
- 1D
- 2
JMJD1B

(2.6) WRKY

WRKY

(3) Домени спіраль-поворот-спіраль

(3.1) Гомеобокс	ARX CDX 1 2 CRX CUTL1 DBX 1 2 DLX 1 2 3 4 5 6 EMX 1 2 EN 1 2 FHL 1 2 3 HESX1 HHEX HLX Гомеобокс A1 A2 A3 A4 A5 A7 A9 A10 A11 A13 B1 B2 B3 B4 B5 B6 B7 B8 B9 B13 C4 C5 C6 C8 C9 C10 C11 C12 C13 D1 D3 D4 D8 D9 D10 D11 D12 D13 HOPX IRX 1 2 3 4 5 6 MKX LMX 1A 1B MEIS 1 2 MEOX2 MNX1 MSX 1 2 NANOG NKX 2-1 2-2 2-3 2-5 3-1 3-2 6-1 6-2 NOBOX PBX 1 2 3 PHF 1 3 6 8 10 16 17 20 21A PHOX 2A 2B PITX 1 2 3 POU PIT-1 BRN-3 A B C Oct 1 2 3/4 6 7 11 OTX 1 2 PDX1 SATB2 SHOX2 SIX 1 2 3 4 5 VAX1 ZEB 1 2

(3.2) Парний бокс	PAX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 PRRX 1 2 RAX

(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль	E2F 1 2 3 4 5 FOX A1 A2 A3 C1 C2 D3 D4 E1 E3 F1 G1 H1 I1 J1 J2 K1 K2 L2 M1 N1 N3 O1 O3 O4 P1 P2 P3 P4

(3.4) Фактори теплового шоку	HSF 1 2 4

(3.5) Триптофановий кластер	ELF 2 4 5 EHF ELK 1 3 4 ERF ETS 1 2 ERG SPIB ETV 1 2 3 4 5 6 FLI1 IRF 1 2 3 4 5 6 7 8 MYB MYBL2

(3.6) Домен транскрипційний енхансер	TEA 1 2 3 4

(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом

(4.1) RHR	NF-κB NFKB1 NFKB2 REL RELA RELB NFAT C1 C2 C3 C4 5

(4.2) STAT	STAT^[en] 1 2 3 4 5 A B 6

(4.3) p53	p53 TBX 1 2 3 5 19 21 22 TBR1 TBR2 TFT MYRF TP63

(4.4) MADS	Mef2 A B C D SRF

(4.6) TATA	TBP TBPL1

(4.7) Високомобільна група	BBX HMGB 1 2 3 4 HMGN 1 2 3 4 HNF 1A 1B LEF1 SOX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 17 18 21 30 SRY SSRP1 TCF 3 4 TOX 1 2 3 4

(4.9) Grainyhead	TFCP2

(4.10) Домен холодового шоку	CSDA YBX1

(4.11) Runt	CBF CBFA2T2 CBFA2T3 RUNX1 RUNX2 RUNX3 RUNX1T1

(0) Інші фактори транскрипції

(0.2) HMGI(Y)	HMGA 1 2 HBP1

(0.3) Pocket домен	Rb RBL1 RBL2

(0.5) AP2/EREBP-подібні	AP2 EREBP B3

(0.6) Інші	ARID 1A 1B 2 3A 3B 4A CAP IFI 16 35 MLL 2 3 T1 MNDA NFY A B C Ро/Сигма