HOXC13

HOXC13
Ідентифікатори
Символи HOXC13, ECTD9, HOX3, HOX3G, homeobox C13
Зовнішні ІД OMIM: 142976 MGI: 99560 HomoloGene: 7770 GeneCards: HOXC13
Пов'язані генетичні захворювання
pure hair-nail type ectodermal dysplasia[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

sequence-specific DNA binding
DNA binding
GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
chromatin binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific

Клітинна компонента

клітинне ядро

Біологічний процес

hair follicle development
multicellular organism development
nail development
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
transcription by RNA polymerase II
transcription, DNA-templated
anterior/posterior pattern specification
tongue morphogenesis
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
anatomical structure morphogenesis

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
3229
15422
Ensembl
ENSG00000123364
ENSMUSG00000001655
UniProt
P31276
P50207
RefSeq (мРНК)
NM_017410
NM_010464
RefSeq (білок)
NP_059106
NP_034594
Локус (UCSC) Хр. 12: 53.94 – 53.95 Mb Хр. 15: 102.83 – 102.84 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

HOXC13 (англ. Homeobox C13) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 330 амінокислот, а молекулярна маса — 35 379[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MTTSLLLHPRWPESLMYVYEDSAAESGIGGGGGGGGGGTGGAGGGCSGAS
PGKAPSMDGLGSSCPASHCRDLLPHPVLGRPPAPLGAPQGAVYTDIPAPE
AARQCAPPPAPPTSSSATLGYGYPFGGSYYGCRLSHNVNLQQKPCAYHPG
DKYPEPSGALPGDDLSSRAKEFAFYPSFASSYQAMPGYLDVSVVPGISGH
PEPRHDALIPVEGYQHWALSNGWDSQVYCSKEQSQSAHLWKSPFPDVVPL
QPEVSSYRRGRKKRVPYTKVQLKELEKEYAASKFITKEKRRRISATTNLS
ERQVTIWFQNRRVKEKKVVSKSKAPHLHST

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з HOXC13 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5125 (англ.) . Архів оригіналу за 8 липня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
  5. UniProt, P31276 (англ.) . Архів оригіналу за 5 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 12
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші