ZNF318

Ідентифікатори

Символи

ZNF318, TZF, ZFP318, HRIHFB2436, zinc finger protein 318

Зовнішні ІД

OMIM: 617512 MGI: 1889348 HomoloGene: 22808 GeneCards: ZNF318

Реагує на сполуку

Viroporin 3a^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • protein homodimerization activity
Клітинна компонента	• клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0007126 мейоз • transcription, DNA-templated • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


24149


57908

Ensembl


ENSG00000171467


ENSMUSG00000015597

UniProt


Q5VUA4


Q99PP2

RefSeq (мРНК)


NM_014345


NM_021346 NM_207671

RefSeq (білок)


NP_055160


NP_067321 NP_997554

Локус (UCSC)

Хр. 6: 43.31 – 43.37 Mb

Хр. 17: 46.69 – 46.73 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

ZNF318 (англ. Zinc finger protein 318) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 279 амінокислот, а молекулярна маса — 251 112^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MYRSSARSSV	SSHRPKDDGG	GGPRSGRSSG	SSSGPARRSS	PPPPPSGSSS
RTPARRPRSP	SGHRGRRASP	SPPRGRRVSP	SPPRARRGSP	SPPRGRRLFP
PGPAGFRGSS	RGESRADYAR	DGRGDHPGDS	GSRRRSPGLC	SDSLEKSLRI
TVGNDHFCVS	TPERRRLSDR	LGSPVDNLED	MDRDDLTDDS	VFTRSSQCSR
GLERYISQEE	GPLSPFLGQL	DEDYRTKETF	LHRSDYSPHI	SCHDELLRGT
ERNREKLKGY	SIRSEERSRE	AKRPRYDDTV	KINSMGGDHP	SFTSGTRNYR
QRRRSPSPRF	LDPEFRELDL	ARRKREEEEE	RSRSLSQELV	GVDGGGTGCS
IPGLSGVLTA	SEPGYSLHRP	EEVSVMPKKS	ILKKRIEVDI	MEPSMQLESF
SSSTSSSQDH	PLYSGHPSLP	LSGAIAAFAS	EIENKGTMVE	TALKEPQGNL
YQWGPLPGIP	KDNSPLREKF	GSFLCHKDNL	DLKAEGPERH	TDFLLPHERA
SQDGSGFSRI	LSMLADSTST	QEKRRRSFPD	IEDEEKFLYG	DEEEDLKAES
VPKPLGSSES	EVMRQKASSL	PSSAPAVKLE	SLEETNPEYA	KIHDLLKTIG
LDIGVAEISQ	LAARTQERLH	GKKPSLRSSA	DRRSSVDRYF	SADHCSSVDH
RFSADRCSSV	DHCFSADRRS	SDPHRLESRE	AHHSNTHSPE	VSHPHPPSPV
DPYLLTKNSP	PFLKSDHPVG	HISGPEVVGS	GFQSSVAVRC	MLPSAPSAPI
RLPHTAALSQ	FHMPRASQFA	AARIPPNYQG	PAIPPASFDA	YRHYMAYAAS
RWPMYPTSQP	SNHPVPEPHR	IMPITKQATR	SRPNLRVIPT	VTPDKPKQKE
SLRGSIPAAQ	VPVQVSIPSL	IRYNPEKISD	EKNRASQKQK	VIEEREKLKN
DREARQKKMY	YLRTELERLH	KQQGEMLRKK	RREKDGHKDP	LLVEVSRLQD
NIMKDIAELR	QEAEEAEKKQ	SELDKVAQIL	GINIFDKSQK	SLSDSREPTE
KPGKAEKSKS	PEKVSSFSNS	SSNKESKVNN	EKFRTKSPKP	AESPQSATKQ
LDQPTAAYEY	YDAGNHWCKD	CNTICGTMFD	FFTHMHNKKH	TQTLDPYNRP
WASKTQSEAK	QDAIKRTDKI	TVPAKGSEFL	VPISGFYCQL	CEEFLGDPIS
GEQHVKGHQH	NEKYKKYVDE	NPLYEERRNL	DRQAGLAVVL	ETERRRQSEL
KRKLSEKPKE	EKKEKKAKAV	KEVKEDDKVS	EKLEDQLSEG	RNSPEKAENK
RNTGIKLQLK	EEVKKESPTS	SSFGKFSWKK	PEKEEEKSSL	VTPSISKEEI
LESSKDKEDG	KTEAGKAKPI	KIKLSGKTVV	AHTSPWMPVV	TTSTQTKIRP
NLPIPSTVLR	KSCSATMSKP	APLNTFLSIK	SSGTTAKPLP	VVKESSADLL
LPPDIISKAF	GGEEVILKGS	PEEKVVLAEK	SEPSHLPEQI	LPPPPPPPPP
PPPPPPVIPH	PAAPSAAQAN	AILAPVKSNP	VVSQTLSPGF	VGPNILNPVL
PVAIMASAQP	AAIPSDETAP	GVSESDRDQT	LFSVLVRPPP	PLSSVFSEQA
KKLEKRNSCL	ATANAKDLYD	IFYSSGGKGA	PETKGAPETK	LSGGPLANGE
NSNLSRTKSS	DTSSTSPLNS	SASQEELHQD	EGLVAAPIVS	NSEKPIAKTL
VALGKWSVVE	HVGPKSTGST	YGFLQPLTRL	CQSRPYETIT	PKTDTLAIWT
SSSFQSDTSR	DISPEKSELD	LGEPGPPGVE	PPPQLLDIQC	KESQKLVEIH
LRESVNQDKE	SQELRKSEDC	RESEIETNTE	LKERVKELSE	GIVDEGVSTS
IGPHSIDDSN	LNHGNRYMWE	GEVKQPNLLM	IDKEAEQSNK	LMTGSETPSK
VVIKLSPQAC	SFTKAKLDSF	LSEARSLLNP	QDTPVKISAP	ELLLHSPARS
AMCLTGSPQE	QGVSVVSEEG	LENSAPESAS	RTSRYRSLKL	KRERSKDFQV
KKIYELAVWD	ENKKRPETWE	SPEKPKTEAL	ELQDVHPELT	VTIESKALED
FEATDLKVEE	LTALGNLGDM	PVDFCTTRVS	PAHRSPTVLC	QKVCEENSVS
PIGCNSSDPA	DFEPIPSFSG	FPLDSPKTLV	LDFETEGERN	SPNPRSVRIP
SPNILKTGLT	ENVDRGLGGL	EGTHQALDLL	AGGMMPEEVK	ESSQLDKQES
LGLELKTINS	AGLGPSPCLP	DLVDFVTRTS	GVQKDKLCSP	LSEPGDPSKC
SSLELGPLQL	EISNASTTEV	AILQVDDDSG	DPLNLVKAPV	SRSPPREQVI
EDNMVPQGMP	EQETTVGAIQ	DHTESSVHN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, мейоз, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Zinc finger protein 318 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13578 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
↑ UniProt, Q5VUA4 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 6

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори

(1) Основні домени

(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)	Фактори актривації транскрипції AATF 1 2 3 4 5 6 7 AP-1 c-Fos FOSB FOSL1 FOSL2 JDP2 c-Jun JUNB JUND BACH 1 2 BATF BLZF1 C/EBP α β γ δ ε ζ CREB 1 3 L1 CREM DBP DDIT3 GABPA GCN4 HLF MAF B F G K NFE 2 L1 L2 L3 NFIL3 NRL NRF 1 2 3 XBP1

(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)	ATOH1 AHR AHRR ARNT ASCL1 BHLH 2 3 9 ARNTL ARNTL ARNTL2 CLOCK EPAS1 FIGLA HAND 1 2 HES 5 6 HEY 1 2 L HES1 HIF 1A 3A ID 1 2 3 4 LYL1 MESP2 MXD4 MYCL MYCN Міогенні фактори MyoD MYOG MYF5 MYF6 Нейрогеніни 1 2 3 НейроD 1 2 NPAS 1 2 3 OLIG 1 2 SIM 1 2 TAL 1 2 TWIST1 USF1

(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)	AP-4 MAX MXD1 MXD3 MITF MNT MLX MLXIPL MXI1 Myc SREBP 1 2

(1.4) NF-1	NFI A B C X SMAD R-SMAD 1 2 3 5 9 I-SMAD 6 7 4)

(1.5) RF-X	RFX 1 2 3 4 5 6 ANK

(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)	AP-2 α β γ δ ε

(2) Цинк-координовані домени ДНК

(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys₄)

підродина 1	Тиреоїдний гормон α β CAR FXR LXR α β PPAR α β/δ γ PXR RAR α β γ ROR α β γ Rev-ErbA α β VDR

підродина 2	COUP-TF I II Ear-2 HNF4 α γ PNR RXR α β γ Тестикулярні рецептори 2 4 TLX

підродина 3	Стероїдні гормони Андроген Естроген α β Глюкокортикоїди Мінералокортикоїди Прогестерон Естроген-зв'язувальні α β γ

підродина 4	NUR NGFIB NOR1 NURR1

підродина 5	LRH-1 SF1

підродина 6	GCNF

підродина 0	DAX1 SHP

(2.2) Інші цинкові пальці Cys₄

GATA
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
MTA
- 1
- 2
- 3
TRPS1

(2.3) Cys₂His₂ з доменом цинкових пальців

Загальні фактори транскрипції
- TFIIA
  - 1
  - 2
- TFIIB
- TFIID
  - TBP
    - L1
    - L2
  - TAF
    - 1
    - 2
    - 3
    - 4
    - 4B
    - 5
    - 6
    - 7
    - 8
    - 9
    - 9B
    - 10
    - 11
    - 12
    - 13
    - 15
- TFIIE
  - 1
  - 2
- TFIIF
  - 1
  - 2
- TFIIH
  - 1
  - 2
  - 4
  - 2I
  - 3A
  - 3C1
  - 3C2

ATBF1
BCL
- 1
- 2
- 3
- 5
- 6
- 6B
- 7A
- 7B
- 7C
- 8
- 9
- 10
- 11A
- 11B
CTCF
E4F1
EGR
- 1
- 2
- 3
- 4
ERV3
GFI1
GLI
- 1
- 2
- 3
- REST
- S1
- S2
- YY1
HIC
- 1
- 2
HIVEP
- 1
- 2
- 3
IKZF
- 1
- 2
- 3
ILF
- 2
- 3
KLF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
- 10
- 11
- 12
- 13
- 14
- 15
- 17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
SALL
- 1
- 2
- 3
- 4
SP
- 1
- 2
- 4
- 7
- 8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
- 7A
- 7B
ZBTB
- 11
- 16
- 17
- 20
- 32
- 33
- 40
цинкові пальці
- 3
- 7
- 9
- 10
- 19
- 22
- 24
- 33B
- 34
- 35
- 41
- 43
- 44
- 51
- 74
- 143
- 146
- 148
- 165
- 202
- 217
- 219
- 238
- 239
- 259
- 267
- 268
- 281
- 295
- 300
- 318
- 330
- 346
- 350
- 365
- 366
- 384
- 423
- 451
- 452
- 471
- 593
- 638
- 644
- 649
- 655

(2.4) Cys₆ цистеїн-цинковий кластер

HIVEP1

(2.5) Цинкові пальці іншого складу

AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
JARID
- 1A
- 1B
- 1C
- 1D
- 2
JMJD1B

(2.6) WRKY

WRKY

(3) Домени спіраль-поворот-спіраль

(3.1) Гомеобокс	ARX CDX 1 2 CRX CUTL1 DBX 1 2 DLX 1 2 3 4 5 6 EMX 1 2 EN 1 2 FHL 1 2 3 HESX1 HHEX HLX Гомеобокс A1 A2 A3 A4 A5 A7 A9 A10 A11 A13 B1 B2 B3 B4 B5 B6 B7 B8 B9 B13 C4 C5 C6 C8 C9 C10 C11 C12 C13 D1 D3 D4 D8 D9 D10 D11 D12 D13 HOPX IRX 1 2 3 4 5 6 MKX LMX 1A 1B MEIS 1 2 MEOX2 MNX1 MSX 1 2 NANOG NKX 2-1 2-2 2-3 2-5 3-1 3-2 6-1 6-2 NOBOX PBX 1 2 3 PHF 1 3 6 8 10 16 17 20 21A PHOX 2A 2B PITX 1 2 3 POU PIT-1 BRN-3 A B C Oct 1 2 3/4 6 7 11 OTX 1 2 PDX1 SATB2 SHOX2 SIX 1 2 3 4 5 VAX1 ZEB 1 2

(3.2) Парний бокс	PAX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 PRRX 1 2 RAX

(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль	E2F 1 2 3 4 5 FOX A1 A2 A3 C1 C2 D3 D4 E1 E3 F1 G1 H1 I1 J1 J2 K1 K2 L2 M1 N1 N3 O1 O3 O4 P1 P2 P3 P4

(3.4) Фактори теплового шоку	HSF 1 2 4

(3.5) Триптофановий кластер	ELF 2 4 5 EHF ELK 1 3 4 ERF ETS 1 2 ERG SPIB ETV 1 2 3 4 5 6 FLI1 IRF 1 2 3 4 5 6 7 8 MYB MYBL2

(3.6) Домен транскрипційний енхансер	TEA 1 2 3 4

(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом

(4.1) RHR	NF-κB NFKB1 NFKB2 REL RELA RELB NFAT C1 C2 C3 C4 5

(4.2) STAT	STAT^[en] 1 2 3 4 5 A B 6

(4.3) p53	p53 TBX 1 2 3 5 19 21 22 TBR1 TBR2 TFT MYRF TP63

(4.4) MADS	Mef2 A B C D SRF

(4.6) TATA	TBP TBPL1

(4.7) Високомобільна група	BBX HMGB 1 2 3 4 HMGN 1 2 3 4 HNF 1A 1B LEF1 SOX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 17 18 21 30 SRY SSRP1 TCF 3 4 TOX 1 2 3 4

(4.9) Grainyhead	TFCP2

(4.10) Домен холодового шоку	CSDA YBX1

(4.11) Runt	CBF CBFA2T2 CBFA2T3 RUNX1 RUNX2 RUNX3 RUNX1T1

(0) Інші фактори транскрипції

(0.2) HMGI(Y)	HMGA 1 2 HBP1

(0.3) Pocket домен	Rb RBL1 RBL2

(0.5) AP2/EREBP-подібні	AP2 EREBP B3

(0.6) Інші	ARID 1A 1B 2 3A 3B 4A CAP IFI 16 35 MLL 2 3 T1 MNDA NFY A B C Ро/Сигма