GTF3C1

Ідентифікатори

Символи

GTF3C1, TFIIIC, TFIIIC220, TFIIICalpha, general transcription factor IIIC subunit 1

Зовнішні ІД

OMIM: 603246 MGI: 107887 HomoloGene: 31040 GeneCards: GTF3C1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA polymerase III general transcription initiation factor activity • RNA polymerase III type 1 promoter sequence-specific DNA binding • RNA polymerase III type 2 promoter sequence-specific DNA binding
Клітинна компонента	• transcription factor TFIIIC complex • ядерце • мембрана • клітинне ядро • нуклеоплазма • Рибонуклеопротеїни
Біологічний процес	• tRNA transcription by RNA polymerase III • rRNA transcription • tRNA transcription • transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase III • regulation of transcription by RNA polymerase III • transcription initiation from RNA polymerase III promoter • 5S class rRNA transcription by RNA polymerase III
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


2975


233863

Ensembl


ENSG00000077235


ENSMUSG00000032777

UniProt


Q12789


Q8K284

RefSeq (мРНК)


NM_001286242 NM_001520


NM_207239

RefSeq (білок)


NP_001273171 NP_001511


NP_997122

Локус (UCSC)

Хр. 16: 27.46 – 27.55 Mb

Хр. 7: 125.24 – 125.31 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

GTF3C1 (англ. General transcription factor IIIC subunit 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 109 амінокислот, а молекулярна маса — 238 875^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDALESLLDE	VALEGLDGLC	LPALWSRLET	RVPPFPLPLE	PCTQEFLWRA
LATHPGISFY	EEPRERPDLQ	LQDRYEEIDL	ETGILESRRD	PVALEDVYPI
HMILENKDGI	QGSCRYFKER	KNITNDIRTK	SLQPRCTMVE	AFDRWGKKLI
IVASQAMRYR	ALIGQEGDPD	LKLPDFSYCI	LERLGRSRWQ	GELQRDLHTT
AFKVDAGKLH	YHRKILNKNG	LITMQSHVIR	LPTGAQQHSI	LLLLNRFHVD
RRSKYDILME	KLSVMLSTRT	NHIETLGKLR	EELGLCERTF	KRLYQYMLNA
GLAKVVSLRL	QEIHPECGPC	KTKKGTDVMV	RCLKLLKEFK	RNDHDDDEDE
EVISKTVPPV	DIVFERDMLT	QTYDLIERRG	TKGISQAEIR	VAMNVGKLEA
RMLCRLLQRF	KVVKGFMEDE	GRQRTTKYIS	CVFAEESDLS	RQYQREKARS
ELLTTVSLAS	MQEESLLPEG	EDTFLSESDS	EEERSSSKRR	GRGSQKDTRA
SANLRPKTQP	HHSTPTKGGW	KVVNLHPLKK	QPPSFPGAAE	ERACQSLASR
DSLLDTSSVS	EPNVSFVSHC	ADSNSGDIAV	IEEVRMENPK	ESSSSLKTGR
HSSGQDKPHE	TYRLLKRRNL	IIEAVTNLRL	IESLFTIQKM	IMDQEKQEGV
STKCCKKSIV	RLVRNLSEEG	LLRLYRTTVI	QDGIKKKVDL	VVHPSMDQND
PLVRSAIEQV	RFRISNSSTA	NRVKTSQPPV	PQGEAEEDSQ	GKEGPSGSGD
SQLSASSRSE	SGRMKKSDNK	MGITPLRNYH	PIVVPGLGRS	LGFLPKMPRL
RVVHMFLWYL	IYGHPASNTV	EKPSFISERR	TIKQESGRAG	VRPSSSGSAW
EACSEAPSKG	SQDGVTWEAE	VELATETVYV	DDASWMRYIP	PIPVHRDFGF
GWALVSDILL	CLPLSIFIQI	VQVSYKVDNL	EEFLNDPLKK	HTLIRFLPRP
IRQQLLYKRR	YIFSVVENLQ	RLCYMGLLQF	GPTEKFQDKD	QVFIFLKKNA
VIVDTTICDP	HYNLARSSRP	FERRLYVLNS	MQDVENYWFD	LQCVCLNTPL
GVVRCPRVRK	NSSTDQGSDE	EGSLQKEQES	AMDKHNLERK	CAMLEYTTGS
REVVDEGLIP	GDGLGAAGLD	SSFYGHLKRN	WIWTSYIINQ	AKKENTAAEN
GLTVRLQTFL	SKRPMPLSAR	GNSRLNIWGE	ARVGSELCAG	WEEQFEVDRE
PSLDRNRRVR	GGKSQKRKRL	KKDPGKKIKR	KKKGEFPGEK	SKRLRYHDEA
DQSALQRMTR	LRVTWSMQED	GLLVLCRIAS	NVLNTKVKGP	FVTWQVVRDI
LHATFEESLD	KTSHSVGRRA	RYIVKNPQAY	LNYKVCLAEV	YQDKALVGDF
MNRRGDYDDP	KVCANEFKEF	VEKLKEKFSS	ALRNSNLEIP	DTLQELFARY
RVLAIGDEKD	QTRKEDELNS	VDDIHFLVLQ	NLIQSTLALS	DSQMKSYQSF
QTFRLYREYK	DHVLVKAFME	CQKRSLVNRR	RVNHTLGPKK	NRALPFVPMS
YQLSQTYYRI	FTWRFPSTIC	TESFQFLDRM	RAAGKLDQPD	RFSFKDQDNN
EPTNDMVAFS	LDGPGGNCVA	VLTLFSLGLI	SVDVRIPEQI	IVVDSSMVEN
EVIKSLGKDG	SLEDDEDEED	DLDEGVGGKR	RSMEVKPAQA	SHTNYLLMRG
YYSPGIVSTR	NLNPNDSIVV	NSCQMKFQLR	CTPVPARLRP	AAAPLEELTM
GTSCLPDTFT	KLINPQENTC	SLEEFVLQLE	LSGYSPEDLT	AALEILEAII
ATGCFGIDKE	ELRRRFSALE	KAGGGRTRTF	ADCIQALLEQ	HQVLEVGGNT
ARLVAMGSAW	PWLLHSVRLK	DREDADIQRE	DPQARPLEGS	SSEDSPPEGQ
APPSHSPRGT	KRRASWASEN	GETDAEGTQM	TPAKRPALQD	SNLAPSLGPG
AEDGAEAQAP	SPPPALEDTA	AAGAAQEDQE	GVGEFSSPGQ	EQLSGQAQPP
EGSEDPRGFT	ESFGAANISQ	AARERDCESV	CFIGRPWRVV	DGHLNLPVCK
GMMEAMLYHI	MTRPGIPESS	LLRHYQGVLQ	PVAVLELLQG	LESLGCIRKR
WLRKPRPVSL	FSTPVVEEVE	VPSSLDESPM	AFYEPTLDCT	LRLGRVFPHE
VNWNKWIHL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

L'Etoile N.D., Fahnestock M.L., Shen Y., Aebersold R., Berk A.J. (1994). Human transcription factor IIIC box B binding subunit. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 91: 1652—1656. PMID 8127861 DOI:10.1073/pnas.91.5.1652
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Lagna G., Kovelman R., Sukegawa J., Roeder R.G. (1994). Cloning and characterization of an evolutionarily divergent DNA-binding subunit of mammalian TFIIIC. Mol. Cell. Biol. 14: 3053—3064. PMID 8164661 DOI:10.1128/MCB.14.5.3053
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
de Planell-Saguer M., Schroeder D.G., Rodicio M.C., Cox G.A., Mourelatos Z. (2009). Biochemical and genetic evidence for a role of IGHMBP2 in the translational machinery. Hum. Mol. Genet. 18: 2115—2126. PMID 19299493 DOI:10.1093/hmg/ddp134

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4664 (англ.) . Архів оригіналу за 16 березня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q12789 (англ.) . Архів оригіналу за 7 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 16

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори

(1) Основні домени

(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)	Фактори актривації транскрипції AATF 1 2 3 4 5 6 7 AP-1 c-Fos FOSB FOSL1 FOSL2 JDP2 c-Jun JUNB JUND BACH 1 2 BATF BLZF1 C/EBP α β γ δ ε ζ CREB 1 3 L1 CREM DBP DDIT3 GABPA GCN4 HLF MAF B F G K NFE 2 L1 L2 L3 NFIL3 NRL NRF 1 2 3 XBP1

(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)	ATOH1 AHR AHRR ARNT ASCL1 BHLH 2 3 9 ARNTL ARNTL ARNTL2 CLOCK EPAS1 FIGLA HAND 1 2 HES 5 6 HEY 1 2 L HES1 HIF 1A 3A ID 1 2 3 4 LYL1 MESP2 MXD4 MYCL MYCN Міогенні фактори MyoD MYOG MYF5 MYF6 Нейрогеніни 1 2 3 НейроD 1 2 NPAS 1 2 3 OLIG 1 2 SIM 1 2 TAL 1 2 TWIST1 USF1

(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)	AP-4 MAX MXD1 MXD3 MITF MNT MLX MLXIPL MXI1 Myc SREBP 1 2

(1.4) NF-1	NFI A B C X SMAD R-SMAD 1 2 3 5 9 I-SMAD 6 7 4)

(1.5) RF-X	RFX 1 2 3 4 5 6 ANK

(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)	AP-2 α β γ δ ε

(2) Цинк-координовані домени ДНК

(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys₄)

підродина 1	Тиреоїдний гормон α β CAR FXR LXR α β PPAR α β/δ γ PXR RAR α β γ ROR α β γ Rev-ErbA α β VDR

підродина 2	COUP-TF I II Ear-2 HNF4 α γ PNR RXR α β γ Тестикулярні рецептори 2 4 TLX

підродина 3	Стероїдні гормони Андроген Естроген α β Глюкокортикоїди Мінералокортикоїди Прогестерон Естроген-зв'язувальні α β γ

підродина 4	NUR NGFIB NOR1 NURR1

підродина 5	LRH-1 SF1

підродина 6	GCNF

підродина 0	DAX1 SHP

(2.2) Інші цинкові пальці Cys₄

GATA
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
MTA
- 1
- 2
- 3
TRPS1

(2.3) Cys₂His₂ з доменом цинкових пальців

Загальні фактори транскрипції
- TFIIA
  - 1
  - 2
- TFIIB
- TFIID
  - TBP
    - L1
    - L2
  - TAF
    - 1
    - 2
    - 3
    - 4
    - 4B
    - 5
    - 6
    - 7
    - 8
    - 9
    - 9B
    - 10
    - 11
    - 12
    - 13
    - 15
- TFIIE
  - 1
  - 2
- TFIIF
  - 1
  - 2
- TFIIH
  - 1
  - 2
  - 4
  - 2I
  - 3A
  - 3C1
  - 3C2

ATBF1
BCL
- 1
- 2
- 3
- 5
- 6
- 6B
- 7A
- 7B
- 7C
- 8
- 9
- 10
- 11A
- 11B
CTCF
E4F1
EGR
- 1
- 2
- 3
- 4
ERV3
GFI1
GLI
- 1
- 2
- 3
- REST
- S1
- S2
- YY1
HIC
- 1
- 2
HIVEP
- 1
- 2
- 3
IKZF
- 1
- 2
- 3
ILF
- 2
- 3
KLF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
- 10
- 11
- 12
- 13
- 14
- 15
- 17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
SALL
- 1
- 2
- 3
- 4
SP
- 1
- 2
- 4
- 7
- 8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
- 7A
- 7B
ZBTB
- 11
- 16
- 17
- 20
- 32
- 33
- 40
цинкові пальці
- 3
- 7
- 9
- 10
- 19
- 22
- 24
- 33B
- 34
- 35
- 41
- 43
- 44
- 51
- 74
- 143
- 146
- 148
- 165
- 202
- 217
- 219
- 238
- 239
- 259
- 267
- 268
- 281
- 295
- 300
- 318
- 330
- 346
- 350
- 365
- 366
- 384
- 423
- 451
- 452
- 471
- 593
- 638
- 644
- 649
- 655

(2.4) Cys₆ цистеїн-цинковий кластер

HIVEP1

(2.5) Цинкові пальці іншого складу

AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
JARID
- 1A
- 1B
- 1C
- 1D
- 2
JMJD1B

(2.6) WRKY

WRKY

(3) Домени спіраль-поворот-спіраль

(3.1) Гомеобокс	ARX CDX 1 2 CRX CUTL1 DBX 1 2 DLX 1 2 3 4 5 6 EMX 1 2 EN 1 2 FHL 1 2 3 HESX1 HHEX HLX Гомеобокс A1 A2 A3 A4 A5 A7 A9 A10 A11 A13 B1 B2 B3 B4 B5 B6 B7 B8 B9 B13 C4 C5 C6 C8 C9 C10 C11 C12 C13 D1 D3 D4 D8 D9 D10 D11 D12 D13 HOPX IRX 1 2 3 4 5 6 MKX LMX 1A 1B MEIS 1 2 MEOX2 MNX1 MSX 1 2 NANOG NKX 2-1 2-2 2-3 2-5 3-1 3-2 6-1 6-2 NOBOX PBX 1 2 3 PHF 1 3 6 8 10 16 17 20 21A PHOX 2A 2B PITX 1 2 3 POU PIT-1 BRN-3 A B C Oct 1 2 3/4 6 7 11 OTX 1 2 PDX1 SATB2 SHOX2 SIX 1 2 3 4 5 VAX1 ZEB 1 2

(3.2) Парний бокс	PAX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 PRRX 1 2 RAX

(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль	E2F 1 2 3 4 5 FOX A1 A2 A3 C1 C2 D3 D4 E1 E3 F1 G1 H1 I1 J1 J2 K1 K2 L2 M1 N1 N3 O1 O3 O4 P1 P2 P3 P4

(3.4) Фактори теплового шоку	HSF 1 2 4

(3.5) Триптофановий кластер	ELF 2 4 5 EHF ELK 1 3 4 ERF ETS 1 2 ERG SPIB ETV 1 2 3 4 5 6 FLI1 IRF 1 2 3 4 5 6 7 8 MYB MYBL2

(3.6) Домен транскрипційний енхансер	TEA 1 2 3 4

(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом

(4.1) RHR	NF-κB NFKB1 NFKB2 REL RELA RELB NFAT C1 C2 C3 C4 5

(4.2) STAT	STAT^[en] 1 2 3 4 5 A B 6

(4.3) p53	p53 TBX 1 2 3 5 19 21 22 TBR1 TBR2 TFT MYRF TP63

(4.4) MADS	Mef2 A B C D SRF

(4.6) TATA	TBP TBPL1

(4.7) Високомобільна група	BBX HMGB 1 2 3 4 HMGN 1 2 3 4 HNF 1A 1B LEF1 SOX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 17 18 21 30 SRY SSRP1 TCF 3 4 TOX 1 2 3 4

(4.9) Grainyhead	TFCP2

(4.10) Домен холодового шоку	CSDA YBX1

(4.11) Runt	CBF CBFA2T2 CBFA2T3 RUNX1 RUNX2 RUNX3 RUNX1T1

(0) Інші фактори транскрипції

(0.2) HMGI(Y)	HMGA 1 2 HBP1

(0.3) Pocket домен	Rb RBL1 RBL2

(0.5) AP2/EREBP-подібні	AP2 EREBP B3

(0.6) Інші	ARID 1A 1B 2 3A 3B 4A CAP IFI 16 35 MLL 2 3 T1 MNDA NFY A B C Ро/Сигма