ZNF24

ZNF24
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1X6E, 3LHR

Ідентифікатори
Символи ZNF24, KOX17, RSG-A, ZNF191, ZSCAN3, Zfp191, zinc finger protein 24
Зовнішні ІД OMIM: 194534 MGI: 1929704 HomoloGene: 5068 GeneCards: ZNF24
Онтологія гена
Молекулярна функція

zinc ion binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
зв'язування з іоном металу
nucleic acid binding
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
sequence-specific DNA binding
DNA binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific

Клітинна компонента

клітинне ядро

Біологічний процес

myelination
GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
transcription, DNA-templated
transcription by RNA polymerase II
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
7572
59057
Ensembl
ENSG00000172466
ENSMUSG00000051469
UniProt
P17028
Q91VN1
RefSeq (мРНК)
NM_001308123
NM_006965
NM_001375815
NM_021559
NM_001357447
NM_001357448
RefSeq (білок)
NP_001295052
NP_008896
NP_001362744
NP_067534
NP_001344376
NP_001344377
Локус (UCSC) Хр. 18: 35.33 – 35.35 Mb Хр. 18: 24.14 – 24.15 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

ZNF24 (англ. Zinc finger protein 24) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 368 амінокислот, а молекулярна маса — 42 155[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MSAQSVEEDSILIIPTPDEEEKILRVKLEEDPDGEEGSSIPWNHLPDPEI
FRQRFRQFGYQDSPGPREAVSQLRELCRLWLRPETHTKEQILELVVLEQF
VAILPKELQTWVRDHHPENGEEAVTVLEDLESELDDPGQPVSLRRRKREV
LVEDMVSQEEAQGLPSSELDAVENQLKWASWELHSLRHCDDDGRTENGAL
APKQELPSALESHEVPGTLNMGVPQIFKYGETCFPKGRFERKRNPSRKKQ
HICDECGKHFSQGSALILHQRIHSGEKPYGCVECGKAFSRSSILVQHQRV
HTGEKPYKCLECGKAFSQNSGLINHQRIHTGEKPYECVQCGKSYSQSSNL
FRHQRRHNAEKLLNVVKV

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Gocke C.B., Yu H., Kang J. (2005). Systematic identification and analysis of mammalian small ubiquitin-like modifier substrates. J. Biol. Chem. 280: 5004—5012. PMID 15561718 DOI:10.1074/jbc.M411718200
  • Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111
  • Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033
  • Thiesen H.-J. (1990). Multiple genes encoding zinc finger domains are expressed in human T cells. New Biol. 2: 363—374. PMID 2288909

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13032 (англ.) . Архів оригіналу за 11 вересня 2015. Процитовано 12 вересня 2017.
  4. UniProt, P17028 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 18
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші