Rodopsinu-slični receptori

Rhodopsin-like receptors

Struktura rodopsina: G protein-spregnutog receptora.^[1]

Identifikatori

Simbol

7tm_1

Pfam

PF00001

InterPro

IPR000276

PROSITE

PDOC00211

SCOP

1f88

SUPERFAMILY

1f88

OPM superfamilija

OPM protein

1gzm

Dostupne proteinske strukture:
Pfam	structures
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

Rodopsinu-slični receptori su familija proteina koja obuhvata najveću grupu G-protein spregnutih receptora.^[2]

Oblast

G-protein-spregnuti receptori, GPCR, su velika proteinska familija koja obuhvata širok spektar funkcija (razne autokrine, parakrine i endokrine procese). Oni manifestuju znatnu raznovrsnost na nivou sekvenci. Na osnovu thi razlika oni su grupisani. GPCR receptori se obično opisuju kao "superfamilija" zato što se mogu podeliti na više familija za koje postoje indikacije o evolucionim odnosima, mada između njih ne postoje statistički značajna sličnost sekvenci.^[2] Trenutno poznati članovi superfamilije su rodopsinu-slični GPCR, sekretinu-slični GPCR, cAMP receptori, gljivični feromonski receptori, i metabotropska glutamatna receptorska familija. Postoje specijalizovane baze podataka za GPCR receptore.^[3]

Klase

Rodopsinu-slični GPCR receptori su klasifikovani u 19 podgrupa (A1-A19) na osnovu filogenetske analize.^[4]

Literatura

^ Palczewski K; Kumasaka T; Hori T; et al. (2000). „Crystal structure of rhodopsin: A G protein-coupled receptor”. Science. 289 (5480): 739—45. PMID 10926528. doi:10.1126/science.289.5480.739. CS1 одржавање: Експлицитна употреба et al. (веза)
^ ^а ^б Attwood TK, Findlay JB (1994). „Fingerprinting G-protein-coupled receptors”. Protein Eng. 7 (2): 195—203. PMID 8170923. doi:10.1093/protein/7.2.195.
^ „Information system for G protein-coupled receptors”. GPCRDB. www.gpcr.org. Архивирано из оригинала 22. 04. 2009. г. Приступљено 05. 12. 2008.
^ Joost P, Methner A (2002). „Phylogenetic analysis of 277 human G-protein-coupled receptors as a tool for the prediction of orphan receptor ligands”. Genome Biol. 3 (11): research0063.1—0063.16. PMC 133447 . PMID 12429062. doi:10.1186/gb-2002-3-11-research0063.

Dodatna literatura

Vriend G, Horn F, Oliveira L, Bywater RP, Cohen FE. „GPCRDB (G Protein-Coupled Receptor Data Base): sequence-derived data.”. Архивирано из оригинала 14. 11. 2007. г. Приступљено 10. 12. 2007.
Horn F, Bettler E, Oliveira L, Campagne F, Cohen FE, Vriend G (2003). „GPCRDB information system for G protein-coupled receptors”. Nucleic Acids Res. 31 (1): 294—7. PMC 165550 . PMID 12520006. doi:10.1093/nar/gkg103.

Transmembranski receptor: receptori spregnuti s G proteinom

Klasa A: Rodopsinu slični

Neurotransmiter

Adrenergički	α1 (A, B, D) • α2 (A, B, C) • β1 • β2 • β3
Purinski	Adenozinski (A1, A2A, A2B, A3) • P2Y (1, 2, 4, 5, 6, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14)
Serotoninski	(svi osim 5-HT3) 5-HT1 (A, B, D, E, F) • 5-HT2 (A, B, C) • 5-HT (4, 5A, 6, 7)
Drugi	Acetilholin (M1, M2, M3, M4, M5) • Dopamin (D1, D2, D3, D4, D5) • Histamin (H1, H2, H3, H4) • Melatonin (1A, 1B, 1C) • TAAR (1, 2, 3, 5, 6, 8, 9)

Metaboliti i
signalni molekuli

Eikozanoidni	CysLT (1, 2) • LTB4 (1, 2) • FPRL1 • OXE • Prostaglandin (DP (1, 2), EP (1, 2, 3, 4), FP) • Prostaciklin • Tromboksan
Drugi	Žučna kiselina • Kanabinoidni (CB1, CB2, GPR (18, 55, 119)) • EBI2 • Estrogen • Slobodna masna kiselina (1, 2, 3, 4) • Laktat • Lizofosfatidna kiselina (1, 2, 3, 4, 5, 6) • Lizofosfolipid (1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8) • Niacin (1, 2) • Oksoglutarat • PAF • Sfingozin-1-fosfat (1, 2, 3, 4, 5) • Sukcinat

Peptid

Neuropeptidni

B/W (1, 2) • FF (1, 2) • S • Y (1, 2, 4, 5) • Neuromedin (B, U (1, 2)) • Neurotenzin (1, 2)

Drugi

Anafilatoksin (C3a, C5a) • Angiotenzin (1, 2) • Apelin • Bombezin (BRS3, GRPR, NMBR) • Bradikinin (B1, B2) • Hemokin • Holecistokinin (A, B) • Endotelin (A, B) • Formil peptid (1, 2, 3) • FSH • Galanin (1, 2, 3) • GHB receptor • Gonadotropin-oslobađajući hormon (1, 2) • Grelin • Kispeptin • Luteinizirajući hormon/horiogonadotropin • MAS (1, 1L, D, E, F, G, X1, X2, X3, X4) • Melanokortin (1, 2, 3, 4, 5) • MCHR (1, 2) • Motilin • Opioidni (δ, κ, μ, Nociceptin & ζ, ali ne σ) • Oreksin (1, 2) • Oksitocin • Prokineticin (1, 2) • Prolaktin-oslobađajući peptid • Relaksin (1, 2, 3, 4) • Somatostatin (1, 2, 3, 4, 5) • Tahikinin (1, 2, 3) • Tirotropin • Tirotropin-oslobađajući hormon • Urotenzin-II • Vazopresin (1A, 1B, 2)

Razno

Orfan	GPR (1, 3, 4, 6, 12, 15, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 25, 26, 27, 31, 32, 33, 34, 35, 37, 39, 42, 44, 45, 50, 52, 55, 61, 62, 63, 65, 68, 75, 77, 78, 81, 82, 83, 84, 85, 87, 88, 92, 101, 103, 109A, 109B, 119, 120, 132, 135, 137B, 139, 141, 142, 146, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 160, 161, 162, 171, 173, 174, 176, 177, 182, 183)
Drugi	Adrenomedulin • Mirisni • Opsin (3, 4, 5, 1LW, 1MW, 1SW, RGR, RRH) • Proteazom-aktivirani (1, 2, 3, 4) • SREB (1, 2, 3)

Klasa B: Sekretinu slični

Orfan	GPR (56, 64, 97, 98, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 123, 124, 125, 126, 128, 133, 143, 144, 155, 157)
Drugi	Moždano specifični angiogenezni inhibitor (1, 2, 3) • Kadherin (1, 2, 3) • Kalcitonin • CALCRL • CD97 • Kortikotropin-oslobađajući hormon (1, 2) • EMR (1, 2, 3) • Glukagon (GR, GIPR, GLP1R, GLP2R) • Hormon rasta • PACAPR1 • GPR • Latrofilin (1, 2, 3, ELTD1) • Metuzalemski protein • Paratiroidni hormon (1, 2) • Sekretin • Vazoaktivni intestinalni peptid (1, 2)

Klasa C: Metabotropni
glutamat / feromon

Ukus	TAS1R (1, 2, 3) • TAS2R (1, 3, 4, 5, 8, 9, 10, 12, 13, 14, 16, 19, 20, 30, 31, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 45, 46, 50)
Drugi	Kalcijum-detektujući receptor • GABA B (1, 2) • Glutamatni receptor (Metabotropni glutamat (1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8)) • GPRC6A • GPR (156, 158, 179) • RAIG (1, 2, 3, 4) • VNR (1, 2, 3, 5)