APOBEC3G

APOBEC3G
已知的結構
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PDBID列表

2JYW、​2KBO、​2KEM、​3E1U、​3IQS、​3IR2、​3V4J、​3V4K、​4ROV、​4ROW

識別號
别名APOBEC3G;, A3G, ARCD, ARP-9, ARP9, CEM-15, CEM15, MDS019, bK150C2.7, dJ494G10.1, apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3G
外部IDOMIM:607113 MGI:1933111 HomoloGene:128348 GeneCards:APOBEC3G
基因位置(小鼠
小鼠15号染色体
染色体小鼠15号染色体[1]
小鼠15号染色体
APOBEC3G的基因位置
APOBEC3G的基因位置
基因座15 E1|15 37.85 cM起始79,775,860 bp[1]
终止79,800,107 bp[1]
基因本體
分子功能 protein homodimerization activity
cytidine deaminase activity
血浆蛋白结合
催化活性
水解酶活性
hydrolase activity, acting on carbon-nitrogen (but not peptide) bonds, in cyclic amidines
金屬離子結合
deoxycytidine deaminase activity
RNA binding
鋅離子結合
dCTP deaminase activity
相同蛋白质结合
細胞組分 细胞核
apolipoprotein B mRNA editing enzyme complex
细胞质基质
細胞質
處理小體
核糖核蛋白
生物學過程 cytidine deamination
negative regulation of single stranded viral RNA replication via double stranded DNA intermediate
negative regulation of transposition
base conversion or substitution editing
immune system process
DNA cytosine deamination
positive regulation of defense response to virus by host
negative regulation of viral genome replication
negative regulation of viral process
defense response to virus
先天免疫系統
viral process
cytidine to uridine editing
DNA去甲基化
Sources:Amigo / QuickGO
直系同源
物種人類小鼠
Entrez

60489

80287

Ensembl

ENSG00000239713

ENSMUSG00000009585

UniProt

Q9HC16

Q99J72

mRNA​序列

​NM_021822

NM_001160415
​NM_030255
​NM_001347041

蛋白序列

NP_068594
​NP_001336365
​NP_001336366
​NP_001336367

NP_001153887
​NP_001333970
​NP_084531

基因位置​(UCSC)无数据Chr 15: 79.78 – 79.8 Mb
PubMed​查找[2][3]
維基數據
檢視/編輯人類檢視/編輯小鼠

APOBEC3G(A3G)是一种阻止HIV复制的蛋白质。这种蛋白质在人类抗病毒的先天免疫中扮演着重要角色。 APOBEC3G作为一种脱氨酶,可以诱导HIV的DNA上的胞嘧啶替换为尿嘧啶, 这就導致完整的前病毒数量减少。慢病毒进化出了一种叫做Vif的基因,透過將APOBEC3G泛素化並降解,来消除这种影响, 但鼠及大多数灵长类的A3G却不能被HIV的Vif识别,这是导致HIV不感染其他动物的一个主要原因。 人的APOBEC3G是一种强有力的逆转录病毒抑制剂。A3G是哺乳动物特有的, 但它在不同物种间的差异却很大。

结构

APOBEC3G的作用原理是在单链DNA复制的过程中使胞嘧啶脱去氨基变成尿嘧啶,它的基因位于第22号染色体。 A3G含有两个典型的胞嘧啶脱氨酶区,其中的C-端已被确认起着调解胞嘧啶脱氨基的作用。 这两个区都分别含有一个催化区,它们是CD1区和CD2区。利用四聚体APOBEC2(A2)蛋白的晶体, 可以推断A3G上的残基存在着电势来调解蛋白质的齐聚反应。 在胞嘧啶脱氨酶区不活跃的N-端上,由酪氨酸-124和色氨酸-127调解着A3G的齐聚反应, 这使得它可以被包装进HIV-1的病毒颗粒中。 A3G在A2模板结构上的同源建模说明它通过二聚体界面形成了一个正电荷堆积的区域。 这个正电荷区域促进了A3G的齐聚反应和提高了它的抗病毒能力。

  1. ^ 1.0 1.1 1.2 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000009585 - Ensembl, May 2017
  2. ^ Human PubMed Reference:. National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine. 
  3. ^ Mouse PubMed Reference:. National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.