SWAP70

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2DN6

Ідентифікатори

Символи

SWAP70, SWAP-70, HSPC321, SWAP switching B-cell complex 70kDa subunit, SWAP switching B-cell complex subunit 70, switching B-cell complex subunit switching B cell complex subunit SWAP70

Зовнішні ІД

OMIM: 604762 MGI: 1298390 HomoloGene: 7557 GeneCards: SWAP70

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • calcium ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • cadherin binding
Клітинна компонента	• cell projection • мембрана • клітинна мембрана • цитоскелет • клітинне ядро • lamellipodium • цитоплазма
Біологічний процес	• positive regulation of cytosolic calcium ion concentration • positive regulation of mast cell chemotaxis • negative regulation of peptidyl-serine dephosphorylation • negative regulation of actin filament depolymerization • actin filament bundle assembly • regulation of protein localization • regulation of actin polymerization or depolymerization • somatic cell DNA recombination • Перемикання класу імуноглобулінів • positive regulation of actin filament bundle assembly • negative regulation of cell-cell adhesion mediated by integrin
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


23075


20947

Ensembl


ENSG00000133789


ENSMUSG00000031015

UniProt


Q9UH65


Q6A028

RefSeq (мРНК)


NM_001297714 NM_015055


NM_009302

RefSeq (білок)


NP_001284643 NP_055870


NP_033328

Локус (UCSC)

Хр. 11: 9.66 – 9.75 Mb

Хр. 7: 109.82 – 109.88 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SWAP70 (англ. SWAP switching B-cell complex subunit 70) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 585 амінокислот, а молекулярна маса — 68 998^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGSLKEELLK	AIWHAFTALD	QDHSGKVSKS	QLKVLSHNLC	TVLKVPHDPV
ALEEHFRDDD	EGPVSNQGYM	PYLNRFILEK	VQDNFDKIEF	NRMCWTLCVK
KNLTKNPLLI	TEEDAFKIWV	IFNFLSEDKY	PLIIVSEEIE	YLLKKLTEAM
GGGWQQEQFE	HYKINFDDSK	NGLSAWELIE	LIGNGQFSKG	MDRQTVSMAI
NEVFNELILD	VLKQGYMMKK	GHRRKNWTER	WFVLKPNIIS	YYVSEDLKDK
KGDILLDENC	CVESLPDKDG	KKCLFLVKCF	DKTFEISASD	KKKKQEWIQA
IHSTIHLLKL	GSPPPHKEAR	QRRKELRKKQ	LAEQEELERQ	MKELQAANES
KQQELEAVRK	KLEEAASRAA	EEEKKRLQTQ	VELQARFSTE	LEREKLIRQQ
MEEQVAQKSS	ELEQYLQRVR	ELEDMYLKLQ	EALEDERQAR	QDEETVRKLQ
ARLLEEESSK	RAELEKWHLE	QQQAIQTTEA	EKQELENQRV	LKEQALQEAM
EQLEQLELER	KQALEQYEEV	KKKLEMATNK	TKSWKDKVAH	HEGLIRLIEP
GSKNPHLITN	WGPAAFTEAE	LEEREKNWKE	KKTTE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, мембрані, клітинних відростках.

Література

Rapalus L., Minegishi Y., Lavoie A., Cunningham-Rundles C., Conley M.E. (2001). Analysis of SWAP-70 as a candidate gene for non-X-linked hyper IgM syndrome and common variable immunodeficiency. Clin. Immunol. 101: 270—275. PMID 11726218 DOI:10.1006/clim.2001.5116
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17070 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9UH65 (англ.) . Архів оригіналу за 8 травня 2016. Процитовано 8 вересня 2017.