SNX13

Ідентифікатори

Символи

SNX13, RGS-PX1, sorting nexin 13

Зовнішні ІД

OMIM: 606589 MGI: 2661416 HomoloGene: 41011 GeneCards: SNX13

Онтологія гена
Молекулярна функція	• phosphatidylinositol binding • phosphatidylinositol-3-phosphate binding • lipid binding
Клітинна компонента	• ендосома • early endosome • early endosome membrane • мембрана
Біологічний процес	• protein transport • negative regulation of signal transduction • intracellular protein transport • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


23161


217463

Ensembl


ENSG00000071189


ENSMUSG00000020590

UniProt


Q9Y5W8


Q6PHS6

RefSeq (мРНК)


NM_015132


NM_001014973

RefSeq (білок)

NP_055947 NP_001337791 NP_001337792 NP_001337793 NP_001337795
NP_001337796 NP_001337797 NP_001337799


NP_001014973

Локус (UCSC)

н/д

Хр. 12: 35.1 – 35.2 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SNX13 (англ. Sorting nexin 13) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 968 амінокислот, а молекулярна маса — 112 189^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLTEASLSIW	GWGSLGIVLF	LITFGPFVIF	YLTFYILCFV	GGGLVVTLLF
GKTNSEKYLE	QCEHSFLPPT	SPGVPKCLEE	MKREARTIKI	DRRLTGANII
DEPLQQVIQF	SLRDYVQYWY	YTLSDDESFL	LEIRQTLQNA	LIQFATRSKE
IDWQPYFTTR	IVDDFGTHLR	VFRKAQQKIT	EKDDQVKGTA	EDLVDTFFEV
EVEMEKEVCR	DLVCTSPKDE	EGFLRDLCEV	LLYLLLPPGD	FQNKIMRYFV
REILARGILL	PLINQLSDPD	YINQYVIWMI	RDSNCNYEAF	MNIIKLSDNI
GELEAVRDKA	AEELQYLRSL	DTAGDDINTI	KNQINSLLFV	KKVCDSRIQR
LQSGKEINTV	KLAANFGKLC	TVPLDSILVD	NVALQFFMDY	MQQTGGQAHL
FFWMTVEGYR	VTAQQQLEVL	LSRQRDGKHQ	TNQTKGLLRA	AAVGIYEQYL
SEKASPRVTV	DDYLVAKLAD	TLNHEDPTPE	IFDDIQRKVY	ELMLRDERFY
PSFRQNALYV	RMLAELDMLK	DPSFRGSDDG	DGESFNGSPT	GSINLSLDDL
SNVSSDDSVQ	LHAYISDTVY	ADYDPYAVAG	VCNDHGKTYA	LYAITVHRRN
LNSEEMWKTY	RRYSDFHDFH	MRITEQFESL	SSILKLPGKK	TFNNMDRDFL
EKRKKDLNAY	LQLLLAPEMM	KASPALAHYV	YDFLENKAYS	KGKGDFARKM
DTFVNPLRNS	MRNVSNAVKS	LPDSLAEGMT	KMSDNMGKMS	ERLGQDIKQS
FFKVPPLIPK	TDSDPEHRRV	SAQLDDNVDD	NIPLRVMLLL	MDEVFDLKER
NQWLRRNIKN	LLQQLIRATY	GDTINRKIVD	HVDWMTSPEQ	VADSVKRFRD
AFWPNGILAE	AVPCRDKSIR	MRTRVAGKTK	LLAIMPDELK	HIIGAETTRK
GILRVFEMFQ	HNQLNRRMVY	VFLEGFLETL	FPQYKFRELF	NKLHSRSKQM
QKYKQKLQTT	QAPSLQKR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до інгібіторів передачі внутрішньоклітинних сигналів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами. Локалізований у мембрані, ендосомах.

Література

Teasdale R.D., Loci D., Houghton F., Karlsson L., Gleeson P.A. (2001). A large family of endosome-localized proteins related to sorting nexin 1. Biochem. J. 358: 7—16. PMID 11485546 DOI:10.1042/0264-6021:3580007
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Hillman R.T., Green R.E., Brenner S.E. (2004). An unappreciated role for RNA surveillance. Genome Biol. 5: R8.1—R8.16. PMID 14759258 DOI:10.1186/gb-2004-5-2-r8

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:21335 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2015. Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9Y5W8 (англ.) . Архів оригіналу за 18 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.