SNIP1

Ідентифікатори

Символи

SNIP1, PMRED, Smad nuclear interacting protein 1, PML1, NEDHCS

Зовнішні ІД

OMIM: 608241 MGI: 2156003 HomoloGene: 110886 GeneCards: SNIP1

Реагує на сполуку

Viroporin 3a^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • mRNA binding • RNA binding
Клітинна компонента	• нуклеоплазма • клітинне ядро • гіалоплазма • U2-type precatalytic spliceosome
Біологічний процес	• positive regulation of protein targeting to mitochondrion • I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • Сайленсинг генів • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • production of miRNAs involved in gene silencing by miRNA • mRNA splicing, via spliceosome
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


79753


76793

Ensembl


ENSG00000163877


ENSMUSG00000050213

UniProt


Q8TAD8


Q8BIZ6

RefSeq (мРНК)


NM_024700


NM_175246 NM_001356560

RefSeq (білок)


NP_078976


NP_780455 NP_001343489

Локус (UCSC)

Хр. 1: 37.53 – 37.55 Mb

Хр. 4: 124.96 – 124.97 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SNIP1 (англ. Smad nuclear interacting protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 396 амінокислот, а молекулярна маса — 45 778^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKAVKSERER	GSRRRHRDGD	VVLPAGVVVK	QERLSPEVAP	PAHRRPDHSG
GSPSPPTSEP	ARSGHRGNRA	RGVSRSPPKK	KNKASGRRSK	SPRSKRNRSP
HHSTVKVKQE	REDHPRRGRE	DRQHREPSEQ	EHRRARNSDR	DRHRGHSHQR
RTSNERPGSG	QGQGRDRDTQ	NLQAQEEERE	FYNARRREHR	QRNDVGGGGS
ESQELVPRPG	GNNKEKEVPA	KEKPSFELSG	ALLEDTNTFR	GVVIKYSEPP
EARIPKKRWR	LYPFKNDEVL	PVMYIHRQSA	YLLGRHRRIA	DIPIDHPSCS
KQHAVFQYRL	VEYTRADGTV	GRRVKPYIID	LGSGNGTFLN	NKRIEPQRYY
ELKEKDVLKF	GFSSREYVLL	HESSDTSEID	RKDDEDEEEE	EEVSDS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як РНК-залежне заглушення генів. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Roche K.C., Wiechens N., Owen-Hughes T., Perkins N.D. (2004). The FHA domain protein SNIP1 is a regulator of the cell cycle and cyclin D1 expression. Oncogene. 23: 8185—8195. PMID 15378006 DOI:10.1038/sj.onc.1208025
Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111
Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Smad nuclear interacting protein 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30587 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q8TAD8 (англ.) . Архів оригіналу за 9 жовтня 2018. Процитовано 28 серпня 2017.