PM20D1 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

PM20D1

Ідентифікатори

Символи

PM20D1, Cps1, peptidase M20 domain containing 1

Зовнішні ІД

OMIM: 617124 MGI: 2442939 HomoloGene: 65049 GeneCards: PM20D1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0070122 peptidase activity • hydrolase activity • зв'язування з іоном металу • hydrolase activity, acting on carbon-nitrogen (but not peptide) bonds, in linear amides • lyase activity
Клітинна компонента	• extracellular region • екзосома • міжклітинний простір
Біологічний процес	• обмін речовин • протеоліз • negative regulation of neuron death • cellular amino acid metabolic process • amide biosynthetic process • cellular amide catabolic process • cellular lipid metabolic process • energy homeostasis • adaptive thermogenesis • regulation of oxidative phosphorylation uncoupler activity • nitrogen compound metabolic process
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


148811


212933

Ensembl


ENSG00000162877


ENSMUSG00000042251

UniProt


Q6GTS8


Q8C165

RefSeq (мРНК)


NM_152491


NM_178079 NM_001357478

RefSeq (білок)


NP_689704


NP_835180 NP_001344407

Локус (UCSC)

Хр. 1: 205.83 – 205.85 Mb

Хр. 1: 131.73 – 131.75 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PM20D1 (англ. Peptidase M20 domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 502 амінокислот, а молекулярна маса — 55 741^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAQRCVCVLA	LVAMLLLVFP	TVSRSMGPRS	GEHQRASRIP	SQFSKEERVA
MKEALKGAIQ	IPTVTFSSEK	SNTTALAEFG	KYIHKVFPTV	VSTSFIQHEV
VEEYSHLFTI	QGSDPSLQPY	LLMAHFDVVP	APEEGWEVPP	FSGLERDGII
YGRGTLDDKN	SVMALLQALE	LLLIRKYIPR	RSFFISLGHD	EESSGTGAQR
ISALLQSRGV	QLAFIVDEGG	FILDDFIPNF	KKPIALIAVS	EKGSMNLMLQ
VNMTSGHSSA	PPKETSIGIL	AAAVSRLEQT	PMPIIFGSGT	VVTVLQQLAN
EFPFPVNIIL	SNPWLFEPLI	SRFMERNPLT	NAIIRTTTAL	TIFKAGVKFN
VIPPVAQATV	NFRIHPGQTV	QEVLELTKNI	VADNRVQFHV	LSAFDPLPVS
PSDDKALGYQ	LLRQTVQSVF	PEVNITAPVT	SIGNTDSRFF	TNLTTGIYRF
YPIYIQPEDF	KRIHGVNEKI	SVQAYETQVK	FIFELIQNAD	TDQEPVSHLH
KL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до ліаз, гідролаз, протеаз. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:26518 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q6GTS8 (англ.) . Архів оригіналу за 7 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.