NECTIN1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3ALP, 3SKU, 3U83, 4FMF, 4MYW

Ідентифікатори

Символи

NECTIN1, CD111, CLPED1, ED4, HIgR, HV1S, HVEC, OFC7, PRR, PRR1, PVRR, PVRR1, SK-12, nectin-1, PVRL1, nectin cell adhesion molecule 1

Зовнішні ІД

OMIM: 600644 MGI: 1926483 HomoloGene: 2138 GeneCards: NECTIN1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein homodimerization activity • coreceptor activity • virus receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • virion binding • signaling receptor binding • carbohydrate binding • cell adhesion molecule binding • identical protein binding • signaling receptor activity
Клітинна компонента	• integral component of membrane • мембрана • внутрішньоклітинна мембранна органела • клітинна мембрана • growth cone membrane • синапс • integral component of plasma membrane • extracellular region • аксон • міжклітинні контакти • neuron projection • catenin complex • presynaptic membrane • apical junction complex • cell-cell contact zone • cell-cell junction • Адгезивні контакти • дендрит (нейробіологія) • hippocampal mossy fiber to CA3 synapse • integral component of presynaptic active zone membrane
Біологічний процес	• heterophilic cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • cell recognition • desmosome organization • regulation of synapse assembly • axon guidance • адгезія клітин • iron ion transport • lens morphogenesis in camera-type eye • retina development in camera-type eye • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • viral entry into host cell • enamel mineralization • GO:0022415 viral process • adherens junction organization • camera-type eye morphogenesis • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • GO:0072468 сигнальна трансдукція • protein localization to cell junction • cell-cell adhesion • virion attachment to host cell
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


5818


58235

Ensembl


ENSG00000110400


ENSMUSG00000032012

UniProt


Q15223


Q9JKF6

RefSeq (мРНК)


NM_203286 NM_002855 NM_032767 NM_203285


NM_021424

RefSeq (білок)


NP_002846 NP_976030 NP_976031


NP_067399

Локус (UCSC)

Хр. 11: 119.62 – 119.73 Mb

Хр. 9: 43.66 – 43.74 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

NECTIN1 (англ. Nectin cell adhesion molecule 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 517 амінокислот, а молекулярна маса — 57 158^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MARMGLAGAA	GRWWGLALGL	TAFFLPGVHS	QVVQVNDSMY	GFIGTDVVLH
CSFANPLPSV	KITQVTWQKS	TNGSKQNVAI	YNPSMGVSVL	APYRERVEFL
RPSFTDGTIR	LSRLELEDEG	VYICEFATFP	TGNRESQLNL	TVMAKPTNWI
EGTQAVLRAK	KGQDDKVLVA	TCTSANGKPP	SVVSWETRLK	GEAEYQEIRN
PNGTVTVISR	YRLVPSREAH	QQSLACIVNY	HMDRFKESLT	LNVQYEPEVT
IEGFDGNWYL	QRMDVKLTCK	ADANPPATEY	HWTTLNGSLP	KGVEAQNRTL
FFKGPINYSL	AGTYICEATN	PIGTRSGQVE	VNITEFPYTP	SPPEHGRRAG
PVPTAIIGGV	AGSILLVLIV	VGGIVVALRR	RRHTFKGDYS	TKKHVYGNGY
SKAGIPQHHP	PMAQNLQYPD	DSDDEKKAGP	LGGSSYEEEE	EEEEGGGGGE
RKVGGPHPKY	DEDAKRPYFT	VDEAEARQDG	YGDRTLGYQY	DPEQLDLAEN
MVSQNDGSFI	SKKEWYV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів клітини-хазяїна для входу вірусу, рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, взаємодія хазяїн-вірус, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, синапсах. Також секретований назовні.

Література

Geraghty R.J., Krummenacher C., Cohen G.H., Eisenberg R.J., Spear P.G. (1998). Entry of alphaherpesviruses mediated by poliovirus receptor-related protein 1 and poliovirus receptor. Science. 280: 1618—1620. PMID 9616127 DOI:10.1126/science.280.5369.1618
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9706 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q15223 (англ.) . Архів оригіналу за 16 травня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 11

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

п о р Білки: кластери диференціації

1-50	CD1 a-c 1A 1D 1E CD2 CD3^[en] γ δ ε CD4 CD5 CD6 CD7 CD8 a CD9 CD10 CD11 a b c d CD13 CD14 CD15 CD16 A B CD18 CD19 CD20 CD21 CD22 CD23 CD24 CD25 CD26 CD27 CD28 CD29 CD30 CD31 CD32 A B CD33 CD34 CD35 CD36 CD37 CD38 CD39 CD40 CD41 CD42 a b c d CD43 CD44 CD45 CD46 CD47 CD48 CD49 a b c d e f CD50

51-100	CD51 CD52 CD53 CD54 CD55 CD56 CD57 CD58 CD59 CD61 CD62 E L P CD63 CD64^[en] A B C CD66 a b c d e f CD68 CD69 CD70 CD71 CD72 CD73 CD74 CD78 CD79 a b CD80 CD81 CD82 CD83 CD84 CD85 a d e h j k CD86 CD87 CD88 CD89 CD90 CD91 CD92 CD93 CD94 CD95 CD96 CD97 CD98 CD99 CD100

101-150	CD101 CD102 CD103 CD104 CD105 CD106 CD107 a b CD108 CD109 CD110 CD111 CD112 CD113 CD114 CD115 CD116 CD117 CD118 CD119 CD120 a b CD121 a b CD122 CD123 CD124 CD125 CD126 CD127 CD129 CD130 CD131 CD132 CD133 CD134 CD135 CD136 CD137 CD138 CD140b CD141 CD142 CD143 CD144 CD146 CD147 CD148 CD150

151-200	CD151 CD152 CD153 CD154 CD155 CD156 a b c CD157 CD158 (a d e i k) CD159 a c CD160 CD161 CD162 CD163 CD164 CD166 CD167 a b CD168 CD169 CD170 CD171 CD172 a b g CD174 CD177 CD178 CD179 a b CD180 CD181 CD182 CD183 CD184 CD185 CD186 CD191 CD192 CD193 CD194 CD195 CD196 CD197 CDw198 CDw199 CD200

201-250	CD201 CD202b CD204 CD205 CD206 CD207 CD208 CD209 CDw210 a b CD212 CD213a 1 2 CD217 CD218 (a b) CD220 CD221 CD222 CD223 CD224 CD225 CD226 CD227 CD228 CD229 CD230 CD233 CD234 CD235 a b CD236 CD238 CD239 CD240CE CD240D CD241 CD243 CD244 CD246 CD247 CD248 CD249

251-300	CD252 CD253 CD254 CD256 CD257 CD258 CD261 CD262 CD263 CD264 CD265 CD266 CD267 CD268 CD269 CD271 CD272 CD273 CD274 CD275 CD276 CD278 CD279 CD280 CD281 CD282 CD283 CD284 CD286 CD288 CD289 CD290 CD292 CDw293 CD294 CD295 CD297 CD298 CD299

301-350	CD300A CD301 CD302 CD303 CD304 CD305 CD306 CD307 CD309 CD312 CD314 CD315 CD316 CD317 CD318 CD320 CD321 CD322 CD324 CD325 CD326 CD328 CD329 CD331 CD332 CD333 CD334 CD335 CD336 CD337 CD338 CD339 CD340 CD344 CD349 CD350