LTBR

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1RF3, 4MXW

Ідентифікатори

Символи

LTBR, CD18, D12S370, LT-BETA-R, TNF-R-III, TNFCR, TNFR-RP, TNFR2-RP, TNFR3, TNFRSF3, lymphotoxin beta receptor

Зовнішні ІД

OMIM: 600979 MGI: 104875 HomoloGene: 1753 GeneCards: LTBR

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • tumor necrosis factor-activated receptor activity • identical protein binding • ubiquitin protein ligase binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • мембрана • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • комплекс Ґольджі
Біологічний процес	• myeloid dendritic cell differentiation • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • positive regulation of JNK cascade • multicellular organism development • cellular response to mechanical stimulus • response to lipopolysaccharide • regulation of cell population proliferation • positive regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway • inflammatory response • GO:0022415 viral process • GO:0072468 сигнальна трансдукція • GO:0097285 апоптоз • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • hematopoietic or lymphoid organ development
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


4055


17000

Ensembl


ENSG00000111321


ENSMUSG00000030339

UniProt


P36941


P50284

RefSeq (мРНК)


NM_001270987 NM_002342


NM_010736

RefSeq (білок)


NP_001257916 NP_002333


NP_034866

Локус (UCSC)

Хр. 12: 6.38 – 6.39 Mb

Хр. 6: 125.28 – 125.29 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

LTBR (англ. Lymphotoxin beta receptor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 435 амінокислот, а молекулярна маса — 46 709^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLLPWATSAP	GLAWGPLVLG	LFGLLAASQP	QAVPPYASEN	QTCRDQEKEY
YEPQHRICCS	RCPPGTYVSA	KCSRIRDTVC	ATCAENSYNE	HWNYLTICQL
CRPCDPVMGL	EEIAPCTSKR	KTQCRCQPGM	FCAAWALECT	HCELLSDCPP
GTEAELKDEV	GKGNNHCVPC	KAGHFQNTSS	PSARCQPHTR	CENQGLVEAA
PGTAQSDTTC	KNPLEPLPPE	MSGTMLMLAV	LLPLAFFLLL	ATVFSCIWKS
HPSLCRKLGS	LLKRRPQGEG	PNPVAGSWEP	PKAHPYFPDL	VQPLLPISGD
VSPVSTGLPA	APVLEAGVPQ	QQSPLDLTRE	PQLEPGEQSQ	VAHGTNGIHV
TGGSMTITGN	IYIYNGPVLG	GPPGPGDLPA	TPEPPYPIPE	EGDPGPPGLS
TPHQEDGKAW	HLAETEHCGA	TPSNRGPRNQ	FITHD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, взаємодія хазяїн-вірус, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані.

Література

Baens M., Chaffanet M., Cassiman J.-J., van den Berghe H., Marynen P. (1993). Construction and evaluation of a hncDNA library of human 12p transcribed sequences derived from a somatic cell hybrid. Genomics. 16: 214—218. PMID 8486360 DOI:10.1006/geno.1993.1161
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Wu M.-Y., Wang P.-Y., Han S.-H., Hsieh S.-L. (1999). The cytoplasmic domain of the lymphotoxin-beta receptor mediates cell death in HeLa cells. J. Biol. Chem. 274: 11868—11873. PMID 10207006 DOI:10.1074/jbc.274.17.11868

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6718 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, P36941 (англ.) . Архів оригіналу за 13 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.