GRIA2
| GRIA2 | |||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
| Ідентифікатори | |||||||||||||||||
| Символи | GRIA2, GLUR2, GLURB, GluA2, GluR-K2, HBGR2, glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 2, gluR-B, gluR-2, NEDLIB | ||||||||||||||||
| Зовнішні ІД | OMIM: 138247 MGI: 95809 HomoloGene: 20225 GeneCards: GRIA2 | ||||||||||||||||
| Реагує на сполуку | |||||||||||||||||
| AMPA, Анірацетам, cx516, CX546, Циклотіазид, IDRA-21, пірацетам, S-18986, GYKI 53655, GYKI-52,466, NBQX, Тезампанел, Аргіотоксин 636[1] | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
| Шаблон експресії | |||||||||||||||||
   | |||||||||||||||||
| Більше даних | |||||||||||||||||
| Ортологи | |||||||||||||||||
| Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
| Entrez |
|
| |||||||||||||||
| Ensembl |
|
| |||||||||||||||
| UniProt |
|
| |||||||||||||||
| RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
| RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
| Локус (UCSC) | Хр. 4: 157.2 – 157.37 Mb | Хр. 3: 80.59 – 80.71 Mb | |||||||||||||||
| PubMed search | [2] | [3] | |||||||||||||||
| Вікідані | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
GRIA2 (англ. Glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 883 амінокислот, а молекулярна маса — 98 821[5].
Послідовність амінокислот
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MQKIMHISVL | LSPVLWGLIF | GVSSNSIQIG | GLFPRGADQE | YSAFRVGMVQ | ||||
| FSTSEFRLTP | HIDNLEVANS | FAVTNAFCSQ | FSRGVYAIFG | FYDKKSVNTI | ||||
| TSFCGTLHVS | FITPSFPTDG | THPFVIQMRP | DLKGALLSLI | EYYQWDKFAY | ||||
| LYDSDRGLST | LQAVLDSAAE | KKWQVTAINV | GNINNDKKDE | MYRSLFQDLE | ||||
| LKKERRVILD | CERDKVNDIV | DQVITIGKHV | KGYHYIIANL | GFTDGDLLKI | ||||
| QFGGANVSGF | QIVDYDDSLV | SKFIERWSTL | EEKEYPGAHT | TTIKYTSALT | ||||
| YDAVQVMTEA | FRNLRKQRIE | ISRRGNAGDC | LANPAVPWGQ | GVEIERALKQ | ||||
| VQVEGLSGNI | KFDQNGKRIN | YTINIMELKT | NGPRKIGYWS | EVDKMVVTLT | ||||
| ELPSGNDTSG | LENKTVVVTT | ILESPYVMMK | KNHEMLEGNE | RYEGYCVDLA | ||||
| AEIAKHCGFK | YKLTIVGDGK | YGARDADTKI | WNGMVGELVY | GKADIAIAPL | ||||
| TITLVREEVI | DFSKPFMSLG | ISIMIKKPQK | SKPGVFSFLD | PLAYEIWMCI | ||||
| VFAYIGVSVV | LFLVSRFSPY | EWHTEEFEDG | RETQSSESTN | EFGIFNSLWF | ||||
| SLGAFMQQGC | DISPRSLSGR | IVGGVWWFFT | LIIISSYTAN | LAAFLTVERM | ||||
| VSPIESAEDL | SKQTEIAYGT | LDSGSTKEFF | RRSKIAVFDK | MWTYMRSAEP | ||||
| SVFVRTTAEG | VARVRKSKGK | YAYLLESTMN | EYIEQRKPCD | TMKVGGNLDS | ||||
| KGYGIATPKG | SSLRNAVNLA | VLKLNEQGLL | DKLKNKWWYD | KGECGSGGGD | ||||
| SKEKTSALSL | SNVAGVFYIL | VGGLGLAMLV | ALIEFCYKSR | AEAKRMKVAK | ||||
| NAQNINPSSS | QNSQNFATYK | EGYNVYGIES | VKI |
Кодований геном білок за функціями належить до глутаматних рецепторів підродини АМРА-рецепторів. Це іонний канал, який відчиняється у відповідь на зв'язування з молекулою глутамінової кислоти та пропускає іони натрію всередину клітини.
На відміну від NMDA-рецепторів та інших АМРА-рецепторів у порі цього каналу в 607-му амінокислотному положенні знаходиться не залишок глутаміну, а залишок аргініну. Це робить іонний канал селективним для іонів натрію, а іони кальцію пройти крізь нього не можуть. Заміна стається завдяки редагуванню матричної РНК цього каналу, і є консервативною для більшості хребетних[6].
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Dev K.K., Nakanishi S., Henley J.M. (2004). The PDZ domain of PICK1 differentially accepts protein kinase C-alpha and GluR2 as interacting ligands. J. Biol. Chem. 279: 41393—41397. PMID 15247289 DOI:10.1074/jbc.M404499200
- Sun W., Ferrer-Montiel A.V., Montal M. (1994). Primary structure and functional expression of the AMPA/kainate receptor subunit 2 from human brain. NeuroReport. 5: 441—444. PMID 8003671
- Paschen W., Hedreen J.C., Ross C.A. (1994). RNA editing of the glutamate receptor subunits GluR2 and GluR6 in human brain tissue. J. Neurochem. 63: 1596—1602. PMID 7523595
Примітки
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з GRIA2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4572 (англ.) . Архів оригіналу за 29 грудня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
- ↑ UniProt, P42262 (англ.) . Архів оригіналу за 21 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
- ↑ Konen, Lyndsey M.; Wright, Amanda L.; Royle, Gordon A.; Morris, Gary P.; Lau, Benjamin K.; Seow, Patrick W.; Zinn, Raphael; Milham, Luke T.; Vaughan, Christopher W.; Vissel, Bryce (2020). A new mouse line with reduced GluA2 Q/R site RNA editing exhibits loss of dendritic spines, hippocampal CA1-neuron loss, learning and memory impairments and NMDA receptor-independent seizure vulnerability. Molecular Brain. 13 (1). doi:10.1186/s13041-020-0545-1. ISSN 1756-6606.
{{cite journal}}: Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)(англ.)
Див. також
- Хромосома 4
 | Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
