CDKN1A

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1AXC, 2ZVV, 2ZVW, 4RJF, 5E0U

Ідентифікатори

Символи

CDKN1A, CAP20, CDKN1, CIP1, MDA-6, P21, SDI1, WAF1, p21CIP1, cyclin-dependent kinase inhibitor 1A, cyclin dependent kinase inhibitor 1A

Зовнішні ІД

OMIM: 116899 MGI: 104556 HomoloGene: 333 GeneCards: CDKN1A

Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • cyclin-dependent protein serine/threonine kinase inhibitor activity • ubiquitin protein ligase binding • cyclin binding • cyclin-dependent protein kinase activating kinase activity • cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity • protein kinase inhibitor activity • protein kinase binding • GO:0032403 protein-containing complex binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • гіалоплазма • cyclin-dependent protein kinase holoenzyme complex • PCNA-p21 complex • perinuclear region of cytoplasm • клітинне ядро • нуклеоплазма • ядерце • ядерні тільця • GO:0009327 protein-containing complex
Біологічний процес	• cellular response to extracellular stimulus • signal transduction by p53 class mediator • intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage by p53 class mediator • cellular response to heat • regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity • DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest • positive regulation of cell death • GO:1904578 response to organic cyclic compound • negative regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity • stress-induced premature senescence • positive regulation of fibroblast proliferation • replicative senescence • response to hyperoxia • response to corticosterone • cellular response to amino acid starvation • positive regulation of programmed cell death • negative regulation of apoptotic process • response to glucocorticoid • response to arsenic-containing substance • regulation of DNA biosynthetic process • response to organic substance • negative regulation of gene expression • cellular response to DNA damage stimulus • GO:1990376 negative regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle • regulation of cell cycle • intrinsic apoptotic signaling pathway • клітинне старіння • positive regulation of reactive oxygen species metabolic process • cellular response to UV-B • G2/M transition of mitotic cell cycle • positive regulation of B cell proliferation • negative regulation of cell growth • response to organonitrogen compound • animal organ regeneration • regulation of mitotic cell cycle • intestinal epithelial cell maturation • cellular response to ionizing radiation • клітинний цикл • Ras protein signal transduction • negative regulation of phosphorylation • response to toxic substance • response to UV • response to X-ray • negative regulation of cell population proliferation • protein stabilization • positive regulation of cyclin-dependent protein kinase activity • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in transcription of p21 class mediator • positive regulation of protein kinase activity • cellular response to gamma radiation • negative regulation of cyclin-dependent protein kinase activity • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • G1/S transition of mitotic cell cycle • cytokine-mediated signaling pathway • negative regulation of vascular associated smooth muscle cell proliferation
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


1026


12575

Ensembl


ENSG00000124762


ENSMUSG00000023067

UniProt


P38936


P39689

RefSeq (мРНК)


NM_078467 NM_000389 NM_001220777 NM_001220778 NM_001291549


NM_001111099 NM_007669

RefSeq (білок)

NP_000380 NP_001207706 NP_001207707 NP_001278478 NP_510867
NP_001361438 NP_001361439 NP_001361440 NP_001361441 NP_001361442


NP_001104569 NP_031695

Локус (UCSC)

Хр. 6: 36.68 – 36.69 Mb

Хр. 17: 29.31 – 29.32 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CDKN1A (англ. Cyclin dependent kinase inhibitor 1A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 164 амінокислот, а молекулярна маса — 18 119^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSEPAGDVRQ	NPCGSKACRR	LFGPVDSEQL	SRDCDALMAG	CIQEARERWN
FDFVTETPLE	GDFAWERVRG	LGLPKLYLPT	GPRRGRDELG	GGRRPGTSPA
LLQGTAEEDH	VDLSLSCTLV	PRSGEQAEGS	PGGPGDSQGR	KRRQTSMTDF
YHSKRRLIFS	KRKP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Harper J.W., Adami G.R., Wei N., Keyomarsi K., Elledge S.J. (1993). The p21 Cdk-interacting protein Cip1 is a potent inhibitor of G1 cyclin-dependent kinases. Cell. 75: 805—816. PMID 8242751 DOI:10.1016/0092-8674(93)90499-G
Noda A., Ning Y., Venable S.F., Pereira-Smith O.M., Smith J.R. (1994). Cloning of senescent cell-derived inhibitors of DNA synthesis using an expression screen. Exp. Cell Res. 211: 90—98. PMID 8125163 DOI:10.1006/excr.1994.1063
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Scott M.T., Morrice N., Ball K.L. (2000). Reversible phosphorylation at the C-terminal regulatory domain of p21(Waf1/Cip1) modulates proliferating cell nuclear antigen binding. J. Biol. Chem. 275: 11529—11537. PMID 10753973 DOI:10.1074/jbc.275.15.11529
Coulombe P., Rodier G., Bonneil E., Thibault P., Meloche S. (2004). N-Terminal ubiquitination of extracellular signal-regulated kinase 3 and p21 directs their degradation by the proteasome. Mol. Cell. Biol. 24: 6140—6150. PMID 15226418 DOI:10.1128/MCB.24.14.6140-6150.2004
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1784 (англ.) . Архів оригіналу за 25 березня 2016. Процитовано 6 вересня 2017.
↑ UniProt, P38936 (англ.) . Архів оригіналу за 31 серпня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.