ASAP1

ASAP1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

2D1X, 2DA0, 2ED1, 2RQT, 2RQU

Ідентифікатори
Символи ASAP1, AMAP1, CENTB4, DDEF1, PAG2, PAP, ZG14P, ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1
Зовнішні ІД OMIM: 605953 MGI: 1342335 HomoloGene: 7684 GeneCards: ASAP1
Онтологія гена
Молекулярна функція

phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate binding
зв'язування з іоном металу
GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity
phosphatidylserine binding
cadherin binding

Клітинна компонента

цитоплазма
гіалоплазма
dendritic spine
мембрана
podosome
cell projection membrane
клітинна мембрана

Біологічний процес

cilium assembly
GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity
negative regulation of dendritic spine development
cell projection organization
positive regulation of podosome assembly
positive regulation of membrane tubulation

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
50807
13196
Ensembl
ENSG00000153317
ENSMUSG00000022377
UniProt
Q9ULH1
Q9QWY8
RefSeq (мРНК)
NM_001247996
NM_018482
NM_001362925
NM_001362926
NM_001362924
NM_001276461
NM_001276462
NM_001276463
NM_001276467
NM_010026
RefSeq (білок)
NP_001234925
NP_060952
NP_001349854
NP_001349855
NP_001349853
NP_001263390
NP_001263391
NP_001263392
NP_001263396
NP_034156
Локус (UCSC) Хр. 8: 130.05 – 130.44 Mb Хр. 15: 63.96 – 64.25 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

ASAP1 (англ. ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 129 амінокислот, а молекулярна маса — 125 498[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MRSSASRLSSFSSRDSLWNRMPDQISVSEFIAETTEDYNSPTTSSFTTRL
HNCRNTVTLLEEALDQDRTALQKVKKSVKAIYNSGQDHVQNEENYAQVLD
KFGSNFLSRDNPDLGTAFVKFSTLTKELSTLLKNLLQGLSHNVIFTLDSL
LKGDLKGVKGDLKKPFDKAWKDYETKFTKIEKEKREHAKQHGMIRTEITG
AEIAEEMEKERRLFQLQMCEYLIKVNEIKTKKGVDLLQNLIKYYHAQCNF
FQDGLKTADKLKQYIEKLAADLYNIKQTQDEEKKQLTALRDLIKSSLQLD
QKEDSQSRQGGYSMHQLQGNKEYGSEKKGYLLKKSDGIRKVWQRRKCSVK
NGILTISHATSNRQPAKLNLLTCQVKPNAEDKKSFDLISHNRTYHFQAED
EQDYVAWISVLTNSKEEALTMAFRGEQSAGENSLEDLTKAIIEDVQRLPG
NDICCDCGSSEPTWLSTNLGILTCIECSGIHREMGVHISRIQSLELDKLG
TSELLLAKNVGNNSFNDIMEANLPSPSPKPTPSSDMTVRKEYITAKYVDH
RFSRKTCSTSSAKLNELLEAIKSRDLLALIQVYAEGVELMEPLLEPGQEL
GETALHLAVRTADQTSLHLVDFLVQNCGNLDKQTALGNTVLHYCSMYSKP
ECLKLLLRSKPTVDIVNQAGETALDIAKRLKATQCEDLLSQAKSGKFNPH
VHVEYEWNLRQEEIDESDDDLDDKPSPIKKERSPRPQSFCHSSSISPQDK
LALPGFSTPRDKQRLSYGAFTNQIFVSTSTDSPTSPTTEAPPLPPRNAGK
GPTGPPSTLPLSTQTSSGSSTLSKKRPPPPPPGHKRTLSDPPSPLPHGPP
NKGAVPWGNDGGPSSSSKTTNKFEGLSQQSSTSSAKTALGPRVLPKLPQK
VALRKTDHLSLDKATIPPEIFQKSSQLAELPQKPPPGDLPPKPTELAPKP
QIGDLPPKPGELPPKPQLGDLPPKPQLSDLPPKPQMKDLPPKPQLGDLLA
KSQTGDVSPKAQQPSEVTLKSHPLDLSPNVQSRDAIQKQASEDSNDLTPT
LPETPVPLPRKINTGKNKVRRVKTIYDCQADNDDELTFIEGEVIIVTGEE
DQEWWIGHIEGQPERKGVFPVSFVHILSD

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як біогенез та деградація війок, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, мембрані.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Kaieda S., Matsui C., Mimori-Kiyosue Y., Ikegami T. (2010). Structural basis of the recognition of the SAMP motif of adenomatous polyposis coli by the Src-homology 3 domain. Biochemistry. 49: 5143—5153. PMID 20509626 DOI:10.1021/bi100563z

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2720 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
  4. UniProt, Q9ULH1 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 8
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій.