Kalcineurin

Kristalografska struktura kalcineurinskog heterodimera formirana od katalitičke (PPP3CA) i regulatorne (PPP3R1) podjedinice.[1]

Kalcineurin (CN) je proteinska fosfataza, takođe poznata kao proteinska fosfataza 3, i kalcijum-zavisna serin-treoninska fosfataza.[2]. On aktivira T ćelije imunskog sistema, i može se blokirati lekovima. Kalcineurin aktivira nuklearni faktor aktiviranih T ćelija, citoplazmni (NFATc) transkripcioni faktor, putem njegove defosforilacije. Aktivirani NFATc se zatim translocira u jedro, gde povećava izražavanje interleukina 2 (IL-2), koji zatim stimuliše rast i diferencijaciju T ćelijskog responsa. Kalcineurin je biološki cilj klase lekova pod nazivom kalcineurinski inhibitori, koja obuhvata ciklosporin, pimekrolimus i takrolimus.

Struktura

Kalcineurin je heterodimer od 61-kD kalmodulin-vezujuće katalitičke podjedinice, kalcineurina A i 19-kD Ca2+-vezujuće regulatorne podjedinice, kalcineurina B. Postoje tri izozima katalitčke podjedinice, svaka od kojih je kodirana zasebnim genom (PPP3CA, PPP3CB, i PPP3CC) i dve regulatorne izoforme, takođe kodirane zasebnim genima (PPP3R1, PPP3R2).

Proteinska fosfataza 3, katalitička podjedinica, alfa izozim
Identifikatori
SimbolPPP3CA
Alt. simboliCALN, CALNA
Entrez5530
HUGO9314
OMIM114105
RefSeqNM_000944
UniProtQ08209
Ostali podaci
EC broj3.1.3.16
LokusHromozom 4 q24
Proteinska fosfataza 3, katalitička podjedinica, beta izozim
Identifikatori
SimbolPPP3CB
Alt. simboliCALNB
Entrez5532
HUGO9315
OMIM114106
RefSeqNM_021132
UniProtP16298
Ostali podaci
EC broj3.1.3.16
LokusHromozom 10 q22.2
Proteinska fosfataza 3, katalitička podjedinica, gama izozim
Identifikatori
SimbolPPP3CC
Entrez5533
HUGO9316
OMIM114107
RefSeqNM_005605
UniProtP48454
Ostali podaci
EC broj3.1.3.16
LokusHromozom 8 p21.3
Proteinska fosfataza 3, regulatorna podjedinica B, alfa
Identifikatori
SimbolPPP3R1
Entrez5534
HUGO9317
OMIM601302
RefSeqNM_000945
UniProtP63098
Ostali podaci
EC broj3.1.3.16
LokusHromozom 2 p14
Proteinska fosfataza 3, regulatorna podjedinica B, beta
Identifikatori
SimbolPPP3R2
Entrez5535
HUGO9318
OMIM613821
RefSeqNM_147180
UniProtQ96LZ3
Ostali podaci
EC broj3.1.3.16
LokusHromozom 9 q31

Reference

  1. ^ PDB: 1AUI​; Kissinger CR, Parge HE, Knighton DR, Lewis CT, Pelletier LA, Tempczyk A, Kalish VJ, Tucker KD, Showalter RE, Moomaw EW (1995). „Crystal structures of human calcineurin and the human FKBP12-FK506-calcineurin complex”. Nature. 378 (6557): 641—4. PMID 8524402. doi:10.1038/378641a0. 
  2. ^ Liu L, Zhang J, Yuan J, Dang Y, Yang C, Chen X, Xu J, Yu L (2005). „Crystal Characterization of a human regulatory subunit of protein phosphatase 3 gene (PPP3RL) expressed specifically in testis”. Mol Biol Rep. 32 (1): 41—45. PMID 15865209. doi:10.1007/s11033-004-4250-4. 

Literatura

  • Crabtree GR (1999). „Generic signals and specific outcomes: signaling through Ca2+, calcineurin, and NF-AT”. Cell. 96 (5): 611—4. PMID 10089876. doi:10.1016/S0092-8674(00)80571-1. 
  • Giri PR, Higuchi S, Kincaid RL (1992). „Chromosomal mapping of the human genes for the calmodulin-dependent protein phosphatase (calcineurin) catalytic subunit”. Biochem. Biophys. Res. Commun. 181 (1): 252—8. PMID 1659808. doi:10.1016/S0006-291X(05)81410-X. 
  • Kincaid RL; Giri PR; Higuchi S; et al. (1990). „Cloning and characterization of molecular isoforms of the catalytic subunit of calcineurin using nonisotopic methods”. J. Biol. Chem. 265 (19): 11312—9. PMID 2162844. CS1 одржавање: Експлицитна употреба et al. (веза)
  • Guerini D, Klee CB (1990). „Cloning of human calcineurin A: evidence for two isozymes and identification of a polyproline structural domain”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 86 (23): 9183—7. PMC 298458 Слободан приступ. PMID 2556704. doi:10.1073/pnas.86.23.9183. 
  • Kincaid RL, Nightingale MS, Martin BM (1988). „Characterization of a cDNA clone encoding the calmodulin-binding domain of mouse brain calcineurin”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 85 (23): 8983—7. PMC 282646 Слободан приступ. PMID 2848250. doi:10.1073/pnas.85.23.8983. 
  • Coghlan VM; Perrino BA; Howard M; et al. (1995). „Association of protein kinase A and protein phosphatase 2B with a common anchoring protein”. Science. 267 (5194): 108—11. PMID 7528941. doi:10.1126/science.7528941. CS1 одржавање: Експлицитна употреба et al. (веза)
  • Griffith JP; Kim JL; Kim EE; et al. (1995). „X-ray structure of calcineurin inhibited by the immunophilin-immunosuppressant FKBP12-FK506 complex”. Cell. 82 (3): 507—22. PMID 7543369. doi:10.1016/0092-8674(95)90439-5. CS1 одржавање: Експлицитна употреба et al. (веза)
  • Shibasaki F, McKeon F (1995). „Calcineurin functions in Ca(2+)-activated cell death in mammalian cells”. J. Cell Biol. 131 (3): 735—43. PMC 2120616 Слободан приступ. PMID 7593193. doi:10.1083/jcb.131.3.735. 
  • Muramatsu T, Kincaid RL (1993). „Molecular cloning of a full-length cDNA encoding the catalytic subunit of human calmodulin-dependent protein phosphatase (calcineurin A alpha)”. Biochim. Biophys. Acta. 1178 (1): 117—20. PMID 8392375. doi:10.1016/0167-4889(93)90117-8. 
  • Cameron AM; Steiner JP; Roskams AJ; et al. (1996). „Calcineurin associated with the inositol 1,4,5-trisphosphate receptor-FKBP12 complex modulates Ca2+ flux”. Cell. 83 (3): 463—72. PMID 8521476. doi:10.1016/0092-8674(95)90124-8. CS1 одржавање: Експлицитна употреба et al. (веза)
  • Kissinger CR; Parge HE; Knighton DR; et al. (1996). „Crystal structures of human calcineurin and the human FKBP12-FK506-calcineurin complex”. Nature. 378 (6557): 641—4. PMID 8524402. doi:10.1038/378641a0. CS1 одржавање: Експлицитна употреба et al. (веза)
  • Wang MG; Yi H; Guerini D; et al. (1997). „Calcineurin A alpha (PPP3CA), calcineurin A beta (PPP3CB) and calcineurin B (PPP3R1) are located on human chromosomes 4, 10q21→q22 and 2p16→p15 respectively”. Cytogenet. Cell Genet. 72 (2–3): 236—41. PMID 8978785. doi:10.1159/000134198. CS1 одржавање: Експлицитна употреба et al. (веза)
  • Shibasaki F, Kondo E, Akagi T, McKeon F (1997). „Suppression of signalling through transcription factor NF-AT by interactions between calcineurin and Bcl-2”. Nature. 386 (6626): 728—31. PMID 9109491. doi:10.1038/386728a0. 
  • Kashishian A; Howard M; Loh C; et al. (1998). „AKAP79 inhibits calcineurin through a site distinct from the immunophilin-binding region”. J. Biol. Chem. 273 (42): 27412—9. PMID 9765270. doi:10.1074/jbc.273.42.27412. CS1 одржавање: Експлицитна употреба et al. (веза)
  • Wang HG; Pathan N; Ethell IM; et al. (1999). „Ca2+-induced apoptosis through calcineurin dephosphorylation of BAD”. Science. 284 (5412): 339—43. PMID 10195903. doi:10.1126/science.284.5412.339. CS1 одржавање: Експлицитна употреба et al. (веза)
  • Fuentes JJ; Genescà L; Kingsbury TJ; et al. (2000). „DSCR1, overexpressed in Down syndrome, is an inhibitor of calcineurin-mediated signaling pathways”. Hum. Mol. Genet. 9 (11): 1681—90. PMID 10861295. doi:10.1093/hmg/9.11.1681. CS1 одржавање: Експлицитна употреба et al. (веза)
  • Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). „DNA Cloning Using In Vitro Site-Specific Recombination”. Genome Res. 10 (11): 1788—95. PMC 310948 Слободан приступ. PMID 11076863. doi:10.1101/gr.143000. 
  • Frey N, Richardson JA, Olson EN (2001). „Calsarcins, a novel family of sarcomeric calcineurin-binding proteins”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 97 (26): 14632—7. PMC 18970 Слободан приступ. PMID 11114196. doi:10.1073/pnas.260501097. 
  • Siddiq A; Miyazaki T; Takagishi Y; et al. (2001). „Expression of ZAKI-4 messenger ribonucleic acid in the brain during rat development and the effect of hypothyroidism”. Endocrinology. 142 (5): 1752—9. PMID 11316738. doi:10.1210/en.142.5.1752. CS1 одржавање: Експлицитна употреба et al. (веза)
  • Nicholas C. Price; Lewis Stevens (1999). Fundamentals of Enzymology: The Cell and Molecular Biology of Catalytic Proteins (Third изд.). USA: Oxford University Press. ISBN 019850229X. 
  • Eric J. Toone (2006). Advances in Enzymology and Related Areas of Molecular Biology, Protein Evolution (Volume 75 изд.). Wiley-Interscience. ISBN 0471205036. 
  • Branden C; Tooze J. Introduction to Protein Structure. New York, NY: Garland Publishing. ISBN 0-8153-2305-0. 
  • Irwin H. Segel. Enzyme Kinetics: Behavior and Analysis of Rapid Equilibrium and Steady-State Enzyme Systems (Book 44 изд.). Wiley Classics Library. ISBN 0471303097. 
  • William P. Jencks (1987). Catalysis in Chemistry and Enzymology. Dover Publications. ISBN 0486654605. 

Vidi još

Spoljašnje veze

  • Calcineurin на US National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH)
  • Calcineurin u rečniku еMedicine
  • п
  • р
  • у
PDB Galerija
  • 1aui​: Ljudski kalcineurinski heterodimer
    1aui: Ljudski kalcineurinski heterodimer
  • 1m63​: Kristalna struktura kalcineurin-ciklofilin-ciklosporina
    1m63: Kristalna struktura kalcineurin-ciklofilin-ciklosporina
  • 1mf8​: Kristalna struktura ljudskog kalcineurina u kompleksu sa ciklosporinom A i ljudskim ciklofilinom
    1mf8: Kristalna struktura ljudskog kalcineurina u kompleksu sa ciklosporinom A i ljudskim ciklofilinom
  • 1tco​: Tercijarni kompleks fragmenta kalcineurina A, kalcineurina B, FKBP12 i imunosupresivnog leka FK506 (Takrolimus)
    1tco: Tercijarni kompleks fragmenta kalcineurina A, kalcineurina B, FKBP12 i imunosupresivnog leka FK506 (Takrolimus)
  • 2jog​: Struktura kalcineurin-NFAT kompleksa
    2jog: Struktura kalcineurin-NFAT kompleksa
  • 2p6b​: Kristalna struktura ljudskog kalcineurina u kompleksu sa PVIVIT peptidom
    2p6b: Kristalna struktura ljudskog kalcineurina u kompleksu sa PVIVIT peptidom
  • p
  • r
  • u
3.1.1: Hidrolaze karboksilnih estara
Holinesteraza (Acetilholinesteraza, Butirilholinesteraza· Pektinesteraza · 6-fosfoglukonolaktonaza · PAF acetilhidrolaza

Lipaza (Zavisna od žučnih soli, Gastrična/Lingvalna, Pankreasna, Lizozomalna, Hormon-sensitivna, Endotelna, Hepatička, Lipoproteinska, Monoacilglicerolna, Diacilglicerolna)

Fosfolipaza (A1, A2, B)
3.1.2: Tioesteraza
Tioesteraza palmitoil proteina · Ubikvitin karboksilni-terminal hidrolaza L1
3.1.3: Fosfataza
Alkalna fosfataza (ALPI, ALPL, ALPP) · Kiselinska fosfataza (Prostatična)/Tartrat-otporna kiselinska fosfataza/Fosfataze purpurne kiseline · Nukleotidaza · Glukoza 6-fosfataza · Fruktoza 1,6-bisfosfataza ·

Kalcineurin · Fosfoproteinska fosfataza (PP2A· OCRL · Piruvat dehidrogenazna fosfataza · Fruktoza 6-P,2-kinaza:fruktoza 2,6-bisfosfataza · PTEN · Fitaza · Іnozitol-fosfat fosfataza (IMPA1)

Fosfoproteinska fosfataza: Proteinska tirozinska fosfataza · Proteinska serin/treoninska fosfataza · Fosfataza dualne-specifičnosti
3.1.4: Fosfodiesteraza
Autotaksin · Fosfolipaza (C, D· Sfingomijelin fosfodiesteraza (1) · PDE1 · PDE2 · PDE3 · PDE4A/PDE4B · PDE5 · Lecitinaza (Clostridium perfringens alfa toksin) · Fosfodiesteraza cikličnih nukleotida
3.1.6: Sulfataza
arilsulfataza (Arilsulfataza A, Arilsulfataza B, Arilsulfataza E, Steroidna sulfataza· Galaktozamine-6 sulfataza · Iduronat-2-sulfataza · N-acetilglukosamin-6-sulfataza
Nukleaza (obuhvata
deoksiribonukleazu i
ribonukleazu)
3.1.11-16: Eksonukleaza
Eksodeoksiribonukleaza
Eksoribonukleaza
3.1.21-31: Endonukleaza
Endodeoksiribonukleaza
Deoksiribonukleaza I · Deoksiribonukleaza II · Deoksiribonukleaza IV · Restrikcioni enzim · UvrABC endonukleaza
Endoribonukleaza
RNaza III · RNaza H (1, 2A, 2B, 2C) · RNaza P · RNaza A (1, 2, 3, 4/5) · RNaza T1 · RNK-indukovani utišavajući kompleks
bilo dezoksi- ili ribo-
Aspergillus nukleaza S1 · Nukleaza mikrokoka
B enzm: 1.1/2/3/4/5/6/7/8/10/11/13/14/15-18, 2.1/2/3/4/5/6/7/8, 2.7.10, 2.7.11-12, 3.1/2/3/4/5/6/7, 3.1.3.48, 3.4.21/22/23/24, 4.1/2/3/4/5/6, 5.1/2/3/4/99, 6.1-3/4/5-6
  • п
  • р
  • у
Teme
Tipovi
  • B enzm: 1.1/2/3/4/5/6/7/8/10/11/13/14/15-18, 2.1/2/3/4/5/6/7/8, 2.7.10, 2.7.11-12, 3.1/2/3/4/5/6/7, 3.1.3.48, 3.4.21/22/23/24, 4.1/2/3/4/5/6, 5.1/2/3/4/99, 6.1-3/4/5-6
Portali:
  •  Molekularna i ćelijska biologija
  •  Hemija
Нормативна контрола Уреди на Википодацима
  • Енциклопедија Британика